245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3198 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  60.73 
 
 
750 aa  946    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  61.2 
 
 
772 aa  927    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  49.43 
 
 
793 aa  739    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  100 
 
 
766 aa  1574    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  59.58 
 
 
767 aa  911    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  45.6 
 
 
780 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  43.56 
 
 
769 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  40.69 
 
 
766 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0465  TonB-dependent receptor  40.99 
 
 
758 aa  535  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  41.52 
 
 
729 aa  528  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  40.7 
 
 
741 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  38.94 
 
 
744 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0965  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 
773 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.195804  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  37.31 
 
 
716 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  37.96 
 
 
721 aa  459  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  35.35 
 
 
775 aa  439  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  36.66 
 
 
713 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  36.29 
 
 
713 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  36.2 
 
 
708 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 
713 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 
713 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  35.94 
 
 
713 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  35.54 
 
 
708 aa  411  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  36.35 
 
 
713 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  35.82 
 
 
713 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3368  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 
717 aa  403  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  34.97 
 
 
714 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  33.07 
 
 
701 aa  342  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 
718 aa  213  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 
705 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 
749 aa  137  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 
705 aa  133  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 
685 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 
681 aa  128  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 
696 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 
697 aa  105  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  23.8 
 
 
725 aa  101  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  23.73 
 
 
698 aa  100  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  23.72 
 
 
699 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 
672 aa  97.8  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  23.14 
 
 
710 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 
668 aa  93.6  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  25.69 
 
 
684 aa  89.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 
702 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  25.99 
 
 
691 aa  87.4  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 
760 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 
699 aa  84.3  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 
683 aa  83.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  22.81 
 
 
695 aa  83.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  26.69 
 
 
687 aa  82.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 
702 aa  81.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  21.05 
 
 
661 aa  81.3  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  21.64 
 
 
749 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 
702 aa  80.1  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  21.65 
 
 
749 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 
702 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  21.45 
 
 
745 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  30.14 
 
 
719 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  21.31 
 
 
753 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  22.18 
 
 
724 aa  77.4  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  21.51 
 
 
745 aa  77  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  30.14 
 
 
723 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  21.51 
 
 
745 aa  77  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  21.51 
 
 
745 aa  77  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 
768 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  28.07 
 
 
681 aa  74.7  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  29.55 
 
 
681 aa  73.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  29.55 
 
 
686 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  24.63 
 
 
710 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  24.63 
 
 
710 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  24.63 
 
 
710 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  25.25 
 
 
709 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  23.27 
 
 
669 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  23.82 
 
 
661 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  25.25 
 
 
687 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  24.83 
 
 
688 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  26.21 
 
 
688 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  26.71 
 
 
688 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  22.05 
 
 
667 aa  68.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  31.9 
 
 
713 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  25.74 
 
 
726 aa  68.2  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  25.86 
 
 
688 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 
698 aa  67  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 
668 aa  67.4  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  25.09 
 
 
667 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  24.34 
 
 
710 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  23.6 
 
 
668 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  23.97 
 
 
668 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  23.89 
 
 
687 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  30.29 
 
 
686 aa  65.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  23.89 
 
 
687 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 
668 aa  64.3  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1945  TonB-dependent receptor, plug  27.91 
 
 
300 aa  64.3  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583164  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  26.67 
 
 
668 aa  63.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  28.11 
 
 
663 aa  62.4  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  22.72 
 
 
656 aa  62  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 
680 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  24.75 
 
 
675 aa  60.8  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 
673 aa  60.5  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  28.51 
 
 
712 aa  60.1  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>