54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3162 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  46.47 
 
 
1143 aa  911    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  46.42 
 
 
1126 aa  906    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  100 
 
 
1124 aa  2289    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  43.04 
 
 
1137 aa  865    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  34.41 
 
 
1118 aa  546  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  32.97 
 
 
1128 aa  545  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  31.69 
 
 
1136 aa  493  9.999999999999999e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  31.34 
 
 
1121 aa  436  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  30.8 
 
 
1140 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  31.25 
 
 
1121 aa  429  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  31.84 
 
 
1124 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  30.97 
 
 
1125 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  30.21 
 
 
1122 aa  422  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  31.38 
 
 
1133 aa  420  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  30.52 
 
 
1121 aa  414  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  31.11 
 
 
1121 aa  416  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  31.65 
 
 
1120 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  30.7 
 
 
1130 aa  411  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  29.22 
 
 
1144 aa  410  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  30.62 
 
 
1121 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  30.03 
 
 
1125 aa  399  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  30.43 
 
 
1123 aa  395  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  28.68 
 
 
1143 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  29.89 
 
 
1151 aa  368  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  27.92 
 
 
1154 aa  360  6e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  28.11 
 
 
1153 aa  357  5e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  29.81 
 
 
1146 aa  348  3e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  28.26 
 
 
1120 aa  324  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  27.86 
 
 
1126 aa  317  9e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  34.06 
 
 
1166 aa  314  5.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  27.71 
 
 
1120 aa  312  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  27.71 
 
 
1120 aa  312  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  27.62 
 
 
1118 aa  311  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  29.14 
 
 
1120 aa  308  4.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  26.98 
 
 
1125 aa  285  4.0000000000000003e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  28.22 
 
 
1114 aa  276  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  27.09 
 
 
1045 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  24.87 
 
 
1133 aa  251  7e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  26.14 
 
 
1121 aa  241  8e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  24.62 
 
 
979 aa  218  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  24.31 
 
 
1181 aa  202  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  28.13 
 
 
694 aa  178  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  43.72 
 
 
352 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  30.38 
 
 
406 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  25.28 
 
 
462 aa  110  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  21.33 
 
 
1109 aa  85.5  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  26.79 
 
 
1207 aa  56.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  24.65 
 
 
1113 aa  55.1  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  24.08 
 
 
1159 aa  53.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  22.56 
 
 
1093 aa  50.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11138  DNA gyrase A subunit  26.92 
 
 
848 aa  46.6  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185535  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  22.98 
 
 
1107 aa  46.2  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  25.39 
 
 
1228 aa  45.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  23.55 
 
 
1159 aa  44.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>