More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3062 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  83.08 
 
 		 397 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  83.33 
 
 		 397 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  84.85 
 
 		 403 aa  704    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  83.33 
 
 		 397 aa  692    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  82.32 
 
 		 397 aa  688    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  85.1 
 
 		 397 aa  705    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5243  tryptophan synthase subunit beta  76.13 
 
 		 418 aa  644    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  83.33 
 
 		 397 aa  692    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  80.56 
 
 		 412 aa  659    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  88.19 
 
 		 399 aa  717    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  83.33 
 
 		 397 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  76.18 
 
 		 399 aa  643    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  85.1 
 
 		 397 aa  705    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  79.64 
 
 		 397 aa  670    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  83.08 
 
 		 397 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  83.84 
 
 		 397 aa  698    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1415  tryptophan synthase subunit beta  77.21 
 
 		 425 aa  656    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  83.08 
 
 		 397 aa  694    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  84.34 
 
 		 397 aa  705    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  83.08 
 
 		 397 aa  694    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  77.53 
 
 		 398 aa  647    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  82.99 
 
 		 397 aa  690    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  83.33 
 
 		 397 aa  692    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1788  tryptophan synthase subunit beta  76.87 
 
 		 435 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  77.83 
 
 		 400 aa  648    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  77.58 
 
 		 447 aa  639    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  83.33 
 
 		 397 aa  696    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3239  tryptophan synthase subunit beta  77.36 
 
 		 422 aa  651    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  81.06 
 
 		 407 aa  674    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  83.08 
 
 		 397 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2592  tryptophan synthase subunit beta  77.11 
 
 		 422 aa  649    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  82.99 
 
 		 397 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  83.33 
 
 		 397 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  79.9 
 
 		 397 aa  672    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  83.08 
 
 		 397 aa  694    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  84.09 
 
 		 397 aa  701    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  78.54 
 
 		 428 aa  640    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 403 aa  832    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1215  tryptophan synthase subunit beta  77.36 
 
 		 422 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236312 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  78.09 
 
 		 434 aa  649    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4868  tryptophan synthase subunit beta  75.99 
 
 		 421 aa  636    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  75.56 
 
 		 405 aa  631  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  74.87 
 
 		 409 aa  617  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  70.96 
 
 		 399 aa  598  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  70.96 
 
 		 399 aa  598  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  70.3 
 
 		 402 aa  594  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  71.9 
 
 		 418 aa  596  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  70.56 
 
 		 394 aa  587  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  69.9 
 
 		 403 aa  585  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  71.32 
 
 		 405 aa  585  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01270  tryptophan synthase subunit beta  69.19 
 
 		 405 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  68.1 
 
 		 401 aa  581  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  69.47 
 
 		 399 aa  575  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  69.47 
 
 		 399 aa  575  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  67.34 
 
 		 424 aa  574  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  67.66 
 
 		 403 aa  575  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  69.87 
 
 		 402 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  69.61 
 
 		 402 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  66.84 
 
 		 424 aa  571  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0728  tryptophan synthase subunit beta  69.37 
 
 		 405 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0644  tryptophan synthase subunit beta  69.11 
 
 		 405 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  67.34 
 
 		 411 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  68.27 
 
 		 406 aa  574  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  68.61 
 
 		 397 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  66.58 
 
 		 415 aa  570  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  68.45 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  67.79 
 
 		 410 aa  567  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  68.31 
 
 		 411 aa  566  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  68.45 
 
 		 405 aa  564  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  68.99 
 
 		 409 aa  567  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  67.09 
 
 		 396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 409 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1261  tryptophan synthase subunit beta  67.68 
 
 		 404 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  67.01 
 
 		 406 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  65.26 
 
 		 404 aa  558  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  65.74 
 
 		 410 aa  558  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  65.57 
 
 		 397 aa  560  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  66.07 
 
 		 405 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  66.07 
 
 		 405 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  65.82 
 
 		 405 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  66.07 
 
 		 405 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  67.94 
 
 		 404 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  66.75 
 
 		 409 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  66.58 
 
 		 406 aa  551  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  66.08 
 
 		 408 aa  553  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  66 
 
 		 406 aa  552  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  65.04 
 
 		 410 aa  551  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  66.5 
 
 		 404 aa  552  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  65.65 
 
 		 411 aa  551  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  66.41 
 
 		 410 aa  553  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  67.44 
 
 		 404 aa  553  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  66.09 
 
 		 406 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  66.09 
 
 		 406 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  67.18 
 
 		 404 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  67.18 
 
 		 404 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  65.25 
 
 		 406 aa  548  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  65.71 
 
 		 409 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  66.58 
 
 		 409 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.244666 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  67.44 
 
 		 396 aa  545  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  64.89 
 
 		 406 aa  547  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>