155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2988 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 
202 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  33.33 
 
 
186 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  34.21 
 
 
186 aa  104  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  27.98 
 
 
187 aa  92.4  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  29.38 
 
 
187 aa  91.7  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.26 
 
 
183 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  28.57 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  26.8 
 
 
186 aa  84.7  7e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  31.69 
 
 
185 aa  84.7  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  30.6 
 
 
190 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  28.12 
 
 
183 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  28.5 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  28.21 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  26.94 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  26.49 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  31.28 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  28.87 
 
 
187 aa  82  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  29.02 
 
 
189 aa  82  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  28.35 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  25.91 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  30.77 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  26.94 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  30.05 
 
 
191 aa  79  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  26.94 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  26.78 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  26.34 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  26.02 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  26.49 
 
 
190 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  30.41 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  30.93 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  30.93 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  28.3 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  27.72 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  27.84 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  28.5 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  25.13 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  25.27 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  28.02 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  25.13 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.18 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  28.26 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  25.26 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  26.74 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  26.74 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  26.09 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  26.8 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  36.36 
 
 
330 aa  68.6  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  28.21 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  28.35 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  28.06 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  26.78 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  42.86 
 
 
330 aa  67  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  28.02 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  27.96 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  25.67 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  25.76 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  25.5 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  38.46 
 
 
333 aa  65.1  0.0000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  25.91 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  41.1 
 
 
324 aa  64.3  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  26.23 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  30.81 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  24.1 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  36.36 
 
 
330 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  37.66 
 
 
323 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  38.96 
 
 
323 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  37.66 
 
 
323 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  37.66 
 
 
323 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  25.26 
 
 
305 aa  58.2  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  25.16 
 
 
309 aa  57  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  25.65 
 
 
299 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.68 
 
 
309 aa  55.1  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.78 
 
 
293 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.71 
 
 
81 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  33.33 
 
 
213 aa  51.6  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  39.68 
 
 
81 aa  51.2  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.33 
 
 
306 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  21.28 
 
 
299 aa  50.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  38.33 
 
 
81 aa  50.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.13 
 
 
296 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  38.33 
 
 
81 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  38.33 
 
 
81 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.78 
 
 
300 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  27.78 
 
 
283 aa  49.3  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  38.1 
 
 
79 aa  49.3  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  36.67 
 
 
81 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.62 
 
 
72 aa  49.3  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  36.67 
 
 
81 aa  48.9  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  36.67 
 
 
81 aa  48.9  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  36.67 
 
 
81 aa  48.9  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  36.67 
 
 
81 aa  48.9  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  36.67 
 
 
81 aa  48.9  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9865  predicted protein  38.46 
 
 
73 aa  48.9  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07223  normal  0.100166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.67 
 
 
76 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  27.82 
 
 
290 aa  48.9  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  28.95 
 
 
281 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  35.21 
 
 
78 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  35.21 
 
 
78 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  35.21 
 
 
78 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  35.21 
 
 
78 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>