More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2983 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2983  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
242 aa  488  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000906081  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2473  DNA-binding response regulator  53.22 
 
 
242 aa  261  6e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  54.7 
 
 
238 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3730  winged helix family two component transcriptional regulator  54.27 
 
 
238 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  53.88 
 
 
249 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2176  two component transcriptional regulator  54.27 
 
 
238 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120128  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65880  putative two-component response regulator  55.7 
 
 
244 aa  248  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0780512  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5717  putative two-component response regulator  55.7 
 
 
245 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0545  two component transcriptional regulator  52.08 
 
 
250 aa  243  2e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0200  two component transcriptional regulator  51.52 
 
 
243 aa  237  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01583  DNA-binding transcriptional regulator TorR  49.79 
 
 
237 aa  235  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003939  TorCAD operon transcriptional regulatory protein TorR  49.57 
 
 
236 aa  234  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0753413  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0777  two-component response regulator  45.3 
 
 
239 aa  234  1e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  3.99592e-06  decreased coverage  0.000157294 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0815  two-component response regulator  45.3 
 
 
239 aa  233  2e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  7.17024e-08  decreased coverage  7.44043e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0601  two-component response regulator  47.23 
 
 
238 aa  233  2e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000457476  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3762  two-component response regulator  45.3 
 
 
239 aa  233  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0487627  decreased coverage  2.65862e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0533  two-component response regulator  44.87 
 
 
238 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0733  two-component response regulator  44.87 
 
 
238 aa  230  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.318798  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00276  two-component response regulator  47.44 
 
 
235 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0786  two-component response regulator  45.96 
 
 
238 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00613295  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1828  DNA-binding transcriptional regulator TorR  47.46 
 
 
240 aa  229  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3988  two-component response regulator  45.96 
 
 
238 aa  228  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3371  two-component response regulator  45.96 
 
 
238 aa  228  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.64227e-07  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3842  two-component response regulator  45.96 
 
 
238 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  8.08868e-05  hitchhiker  9.62447e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3660  two-component response regulator  45.96 
 
 
238 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0335884  decreased coverage  8.14721e-11 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0651  two-component response regulator  45.96 
 
 
238 aa  228  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000404261  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0650  two-component response regulator  45.96 
 
 
238 aa  228  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.23196e-07  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0678  two-component response regulator  45.96 
 
 
238 aa  228  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.57437e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3719  two-component response regulator  45.96 
 
 
238 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.24737e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1985  DNA-binding transcriptional regulator TorR  48.92 
 
 
232 aa  228  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1874  two component transcriptional regulator  52.17 
 
 
235 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1322  DNA-binding transcriptional regulator TorR  48.71 
 
 
234 aa  225  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  6.12091e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2984  two-component response regulator  44.44 
 
 
238 aa  224  9e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4949  two-component response regulator  44.02 
 
 
238 aa  221  8e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0562  two-component response regulator  44.21 
 
 
238 aa  221  9e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  48.71 
 
 
242 aa  221  1e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3606  two-component response regulator  44.92 
 
 
238 aa  221  1e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0811  two-component response regulator  44.92 
 
 
238 aa  221  1e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5000  two-component response regulator  43.59 
 
 
238 aa  219  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0531  two-component response regulator  44.02 
 
 
238 aa  219  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3596  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 
238 aa  219  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04277  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with ArcB or CpxA  43.59 
 
 
238 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.896117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5916  two-component response regulator  43.59 
 
 
238 aa  219  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.284367  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04242  hypothetical protein  43.59 
 
 
238 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.889846  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4637  two-component response regulator  43.59 
 
 
238 aa  219  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4496  two-component response regulator  46.78 
 
 
233 aa  219  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4952  two-component response regulator  43.59 
 
 
238 aa  219  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal  0.89803 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3478  two-component response regulator  44.49 
 
 
238 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3655  two-component response regulator  43.59 
 
 
238 aa  219  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115907  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0681  two-component response regulator  44.49 
 
 
238 aa  219  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  2.76194e-06  normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5008  two-component response regulator  43.78 
 
 
238 aa  219  4e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.80206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4922  two-component response regulator  43.78 
 
 
238 aa  219  4e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000490343  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4956  two-component response regulator  43.78 
 
 
238 aa  219  4e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.211871  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4849  two-component response regulator  43.78 
 
 
238 aa  219  4e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5012  two-component response regulator  43.78 
 
 
238 aa  219  4e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0537303  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.37 
 
 
245 aa  218  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0570  two-component response regulator  43.59 
 
 
238 aa  218  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.275144  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1150  DNA-binding transcriptional regulator TorR  49.79 
 
 
236 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0713  two-component response regulator  43.64 
 
 
238 aa  218  7e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3217  DNA-binding transcriptional regulator TorR  49.79 
 
 
236 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3217  DNA-binding transcriptional regulator TorR  49.79 
 
 
236 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3865  two-component response regulator  44.68 
 
 
238 aa  218  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  2.88449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3356  DNA-binding transcriptional regulator TorR  49.79 
 
 
236 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 
232 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 
232 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0082  two-component response regulator  46.15 
 
 
235 aa  217  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3671  two-component response regulator  44.26 
 
 
238 aa  216  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2803  DNA-binding transcriptional regulator TorR  47.74 
 
 
241 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1947  two-component response regulator  44.02 
 
 
238 aa  216  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.43409e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1047  DNA-binding transcriptional regulator TorR  48.52 
 
 
236 aa  215  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.499715  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1195  two-component response regulator  42.44 
 
 
238 aa  215  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1051  DNA-binding transcriptional regulator TorR  48.52 
 
 
236 aa  215  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.44318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1112  DNA-binding transcriptional regulator TorR  48.52 
 
 
236 aa  215  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00933  two-component response regulator  42.74 
 
 
238 aa  214  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004461  aerobic respiration control protein ArcA  43.22 
 
 
238 aa  213  2e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  1.05121e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4035  DNA-binding transcriptional regulator TorR  48.5 
 
 
242 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4156  DNA-binding transcriptional regulator TorR  48.5 
 
 
242 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4214  DNA-binding transcriptional regulator TorR  48.5 
 
 
242 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4107  DNA-binding transcriptional regulator TorR  48.5 
 
 
242 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4052  DNA-binding transcriptional regulator TorR  48.5 
 
 
242 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1228  DNA-binding transcriptional regulator TorR  48.52 
 
 
236 aa  210  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3347  DNA-binding transcriptional regulator TorR  48.73 
 
 
236 aa  209  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000384276  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 
275 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3534  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.94 
 
 
243 aa  209  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.176306 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2052  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.15 
 
 
242 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293024  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2279  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 
234 aa  208  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.957974 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2558  two-component response regulator  42.55 
 
 
239 aa  208  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1990  DNA-binding transcriptional regulator TorR  49.15 
 
 
241 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3367  DNA-binding transcriptional regulator TorR  49.36 
 
 
236 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0983  DNA-binding transcriptional regulator TorR  47.46 
 
 
236 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.291581 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.28 
 
 
241 aa  201  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  46.28 
 
 
241 aa  201  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3241  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.86 
 
 
237 aa  200  2e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  42.74 
 
 
245 aa  199  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.87 
 
 
240 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  43.8 
 
 
251 aa  197  1e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2600  DNA-binding transcriptional regulator TorR  45.76 
 
 
230 aa  197  1e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1106  DNA-binding transcriptional regulator TorR  45.76 
 
 
230 aa  197  1e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00998  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with TorS  45.76 
 
 
230 aa  197  1e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2647  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 
230 aa  197  1e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>