More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2869 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  54.09 
 
 		 681 aa  717    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 742 aa  1505    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  50.41 
 
 		 726 aa  700    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  52.6 
 
 		 710 aa  744    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  52.17 
 
 		 694 aa  702    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  52.9 
 
 		 706 aa  744    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  45.26 
 
 		 720 aa  570  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  45.02 
 
 		 709 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  42.42 
 
 		 728 aa  524  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  42.16 
 
 		 715 aa  508  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  42.12 
 
 		 706 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  41.65 
 
 		 700 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  41.65 
 
 		 700 aa  503  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  41.51 
 
 		 700 aa  499  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  41.69 
 
 		 706 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  41.83 
 
 		 706 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  41.36 
 
 		 700 aa  502  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  41.51 
 
 		 700 aa  500  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  41.51 
 
 		 700 aa  500  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  41.98 
 
 		 706 aa  502  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  41.83 
 
 		 721 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  41.51 
 
 		 700 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  43.47 
 
 		 697 aa  497  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  41.45 
 
 		 700 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  41.45 
 
 		 700 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  42.29 
 
 		 712 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  41.1 
 
 		 736 aa  471  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  38.38 
 
 		 706 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  41.8 
 
 		 743 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  39.45 
 
 		 731 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  39.21 
 
 		 705 aa  448  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  40.91 
 
 		 723 aa  422  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  34.85 
 
 		 701 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  38.67 
 
 		 723 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 675 aa  321  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 688 aa  306  8.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 678 aa  275  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 705 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  30.36 
 
 		 691 aa  256  9e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 680 aa  211  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  24.53 
 
 		 701 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 742 aa  144  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 726 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 736 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 770 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 734 aa  134  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 780 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  23.55 
 
 		 727 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 682 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 769 aa  124  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  23.22 
 
 		 762 aa  121  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  23.74 
 
 		 703 aa  121  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 681 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 739 aa  117  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 777 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 777 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 737 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 696 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 757 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 777 aa  111  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 681 aa  110  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 657 aa  108  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  26.68 
 
 		 666 aa  108  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 713 aa  107  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  23.42 
 
 		 741 aa  107  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 741 aa  106  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  22.75 
 
 		 788 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 715 aa  105  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 717 aa  105  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  23.43 
 
 		 690 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  26.31 
 
 		 797 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 700 aa  102  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 688 aa  101  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 740 aa  101  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 705 aa  100  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 644 aa  100  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 678 aa  98.6  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 705 aa  98.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 706 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 702 aa  97.4  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 776 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 714 aa  95.5  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3269  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 688 aa  95.5  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 698 aa  95.1  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 778 aa  94  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 687 aa  92.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  21.83 
 
 		 680 aa  92.8  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 774 aa  91.7  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 686 aa  91.3  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 801 aa  91.3  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 655 aa  90.9  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 779 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 720 aa  88.6  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 		 753 aa  88.6  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 733 aa  87.4  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  24.33 
 
 		 828 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 656 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.66 
 
 		 1023 aa  86.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 820 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  24.88 
 
 		 787 aa  85.9  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>