More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2831 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3006  PAS  38.54 
 
 
1560 aa  646    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1407 aa  2845    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.67 
 
 
1064 aa  548  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.47 
 
 
1135 aa  533  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 
1029 aa  467  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.8 
 
 
1275 aa  466  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.18 
 
 
873 aa  458  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 
1110 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.32 
 
 
982 aa  453  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 
1287 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  47.31 
 
 
1028 aa  442  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2451  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.38 
 
 
846 aa  438  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414748 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  51.95 
 
 
794 aa  435  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.06 
 
 
865 aa  436  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  42.6 
 
 
955 aa  433  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  40.33 
 
 
853 aa  432  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 
1066 aa  429  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  43.24 
 
 
1023 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.57 
 
 
860 aa  418  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.71 
 
 
762 aa  419  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  49.54 
 
 
787 aa  411  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 
945 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  51.7 
 
 
759 aa  405  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  51.24 
 
 
655 aa  399  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  47.67 
 
 
659 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 
1313 aa  392  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  47.49 
 
 
777 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 
1788 aa  369  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 
846 aa  366  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
1195 aa  365  5.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 
841 aa  364  8e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 
1127 aa  363  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 
926 aa  362  3e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  40.25 
 
 
764 aa  362  4e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  39.77 
 
 
1026 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 
1229 aa  359  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 
1053 aa  358  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  36.65 
 
 
982 aa  357  7.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 
781 aa  357  8.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
2654 aa  357  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 
932 aa  351  7e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.12 
 
 
781 aa  348  4e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
1611 aa  347  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.61 
 
 
1959 aa  347  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.37 
 
 
791 aa  346  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 
902 aa  345  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
1965 aa  342  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
1622 aa  341  5e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  46.51 
 
 
735 aa  338  5.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 
927 aa  338  5.999999999999999e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  46.78 
 
 
596 aa  338  5.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 
944 aa  335  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 
959 aa  335  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  35.57 
 
 
968 aa  334  6e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 
1313 aa  334  8e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2105  PAS  41.76 
 
 
680 aa  333  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
1397 aa  333  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
882 aa  332  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.52 
 
 
724 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
1120 aa  329  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.09 
 
 
1452 aa  328  4.0000000000000003e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.62 
 
 
763 aa  328  6e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 
957 aa  327  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 
1049 aa  325  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 
1075 aa  325  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
1596 aa  325  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 
827 aa  325  5e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 
1124 aa  324  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
817 aa  324  8e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 
846 aa  323  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
1326 aa  323  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.7 
 
 
1548 aa  322  3e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29290  hybrid histidine protein kinase  44.57 
 
 
826 aa  322  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
1369 aa  322  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 
1177 aa  322  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 
717 aa  321  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 
1169 aa  320  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 
984 aa  320  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.23 
 
 
921 aa  320  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 
1305 aa  320  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
718 aa  320  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 
1820 aa  317  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.37 
 
 
1199 aa  317  9e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 
785 aa  317  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 
1433 aa  317  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 
1222 aa  317  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
1109 aa  316  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
1033 aa  316  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.07 
 
 
756 aa  316  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2895  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 
1324 aa  316  1.9999999999999998e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000343468  normal  0.0609683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 
1358 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1622  PAS  40.98 
 
 
802 aa  315  4.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.2135  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.01 
 
 
1005 aa  314  5.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 
1363 aa  313  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.72 
 
 
1009 aa  313  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3174  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.13 
 
 
1087 aa  313  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  44.56 
 
 
858 aa  313  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 
827 aa  313  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 
1350 aa  313  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.54 
 
 
1165 aa  312  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>