More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2794 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  100 
 
 		 330 aa  668    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  55.66 
 
 		 327 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  48.33 
 
 		 328 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  45.32 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  46.13 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  45.76 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  41.45 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  41.95 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  41.62 
 
 		 339 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  38.33 
 
 		 340 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  40.24 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  41.82 
 
 		 347 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  42.42 
 
 		 340 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  42.58 
 
 		 352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  38.57 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  39.65 
 
 		 351 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  41.43 
 
 		 339 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  39.76 
 
 		 351 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  39.82 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  39.82 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  36.99 
 
 		 354 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  40.69 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  41.91 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  46.64 
 
 		 222 aa  193  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  38.85 
 
 		 373 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  40.57 
 
 		 395 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  42.71 
 
 		 366 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  34.95 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  39.37 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  38.68 
 
 		 374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  34.59 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  33.33 
 
 		 353 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  38.83 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  39.08 
 
 		 374 aa  176  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  41.18 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3178  phage integrase family protein  32.84 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0368902  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7113  integrase family protein  33.33 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596865 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3193  integrase family protein  36.31 
 
 		 365 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1220  integrase  39.11 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1794  integrase family protein  31.23 
 
 		 343 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0543031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  41.55 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  29.85 
 
 		 321 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  31.12 
 
 		 354 aa  125  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  31.12 
 
 		 354 aa  125  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  27.68 
 
 		 531 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  33.71 
 
 		 380 aa  122  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0471  integrase family protein  29.85 
 
 		 398 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116709  hitchhiker  0.000616461 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1152  integrase family protein  28.18 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.379304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2234  integrase family protein  29.89 
 
 		 341 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  27.57 
 
 		 571 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2576  integrase family protein  31.41 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.478177  hitchhiker  0.000378812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2610  integrase family protein  31.41 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0241311  unclonable  5.16639e-16 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03811  site-specific recombinase XerD  27.47 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01212  site-specific recombinase, resolvase family protein  27.24 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1421  phage integrase family protein  31.66 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  33.78 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1711  integrase family protein  25.21 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213299  hitchhiker  0.00000987295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3125  Phage integrase  31.14 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  36.17 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  28.63 
 
 		 278 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2435  integrase family protein  28.99 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.061585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  34.6 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2030  phage integrase family protein  28.4 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3455  putative integrase/recombinase  27.56 
 
 		 362 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375642  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  33.62 
 
 		 386 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2363  phage integrase family site specific recombinase  26.77 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3278  phage integrase family site specific recombinase  45.67 
 
 		 146 aa  99.4  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0397  shufflon-specific DNA recombinase  26.84 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  30.7 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  27.93 
 
 		 405 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  30 
 
 		 397 aa  97.1  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1622  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 361 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  30.17 
 
 		 386 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  28.83 
 
 		 396 aa  93.2  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  30.91 
 
 		 482 aa  92.4  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0745  phage integrase family protein  24.37 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107824 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  32.86 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  30.98 
 
 		 402 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0354  phage integrase family site specific recombinase  25.36 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  28.47 
 
 		 379 aa  91.3  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  30.43 
 
 		 429 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  29.62 
 
 		 338 aa  90.1  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3130  integrase, putative  35.29 
 
 		 147 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.986552  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  30.94 
 
 		 412 aa  89.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0398  shufflon-specific DNA recombinase  24.84 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  30.47 
 
 		 365 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0382  putative site-specific integrase/recombinase  31.53 
 
 		 204 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  22.49 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03598  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.9 
 
 		 380 aa  87.4  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.951563  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2042  integrase family protein  26.38 
 
 		 350 aa  86.7  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0960893  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4490  phage integrase family protein  26.28 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6537  normal  0.0343494 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5550  phage integrase family protein  25.32 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1667  phage integrase family protein  38.75 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0773  phage integrase family protein  25.76 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  30.67 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0798  integrase family protein  25.76 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000196141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3586  phage integrase family protein  25.45 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0805  phage integrase family protein  25.15 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  29.78 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  30.67 
 
 		 387 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>