130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2692 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 
286 aa  550  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  41.6 
 
 
306 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2311  Flp pilus assembly protein CpaB  35.66 
 
 
258 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0646  SAF domain-containing protein  30.6 
 
 
298 aa  102  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.361703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  29.26 
 
 
298 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0706  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  29.85 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  29.74 
 
 
234 aa  85.1  1e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4344  Flp pilus assembly protein CpaB  29.25 
 
 
339 aa  82.8  6e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2919  putative Flp pilus assembly CpaB  26.46 
 
 
363 aa  80.1  4e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  33.51 
 
 
292 aa  76.6  5e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  28.63 
 
 
279 aa  74.7  1e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  27.07 
 
 
274 aa  75.1  1e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  36.75 
 
 
233 aa  73.6  4e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  28.46 
 
 
279 aa  73.6  4e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  28.46 
 
 
279 aa  73.6  4e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  26.99 
 
 
284 aa  72  9e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  28.38 
 
 
272 aa  72  1e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6874  Flp pilus assembly protein CpaB  24.76 
 
 
366 aa  70.1  3e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.367067  normal  0.327856 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  27.05 
 
 
291 aa  70.5  3e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  29.17 
 
 
261 aa  70.5  3e-11  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  28.28 
 
 
272 aa  69.3  6e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  27.71 
 
 
291 aa  68.9  9e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  23.87 
 
 
251 aa  67.4  2e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  27.44 
 
 
271 aa  67.4  2e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  27.49 
 
 
291 aa  68.2  2e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  30.68 
 
 
261 aa  67  3e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  27.57 
 
 
279 aa  67.4  3e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  28.46 
 
 
274 aa  67  3e-10  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  30.68 
 
 
261 aa  67.4  3e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  30.86 
 
 
233 aa  65.9  7e-10  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  27.23 
 
 
342 aa  65.1  1e-09  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  24.59 
 
 
282 aa  64.7  1e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  24.51 
 
 
295 aa  65.1  1e-09  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.50468e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  27.59 
 
 
292 aa  64.7  2e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  27.78 
 
 
272 aa  63.9  3e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  27.13 
 
 
345 aa  63.9  3e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  26.97 
 
 
288 aa  63.5  4e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  31.54 
 
 
269 aa  62.8  7e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  30.7 
 
 
316 aa  62  1e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  31.58 
 
 
316 aa  61.6  1e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  24.24 
 
 
269 aa  61.2  2e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  24.49 
 
 
296 aa  60.5  3e-08  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  27.16 
 
 
269 aa  60.1  4e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  28.16 
 
 
281 aa  59.7  5e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  25.88 
 
 
289 aa  59.3  6e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  25.33 
 
 
272 aa  59.7  6e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  25 
 
 
283 aa  59.3  8e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  27.89 
 
 
260 aa  59.3  8e-08  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  27.76 
 
 
281 aa  58.5  1e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  24.54 
 
 
296 aa  57.8  2e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.51 
 
 
348 aa  58.2  2e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1757  Flp pilus assembly protein CpaB  29.26 
 
 
243 aa  57.4  3e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.336594  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  32.18 
 
 
270 aa  57.4  3e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  28.51 
 
 
299 aa  57  4e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1291  hypothetical protein  28.51 
 
 
299 aa  57  4e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  24.81 
 
 
286 aa  57  4e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  28.51 
 
 
299 aa  57  4e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1049  putative pilus assembly protein CpaB  28.51 
 
 
299 aa  57  4e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.342434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1779  hypothetical protein  28.51 
 
 
299 aa  57  4e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  27.31 
 
 
263 aa  56.6  5e-07  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  27.72 
 
 
281 aa  56.6  5e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  27.72 
 
 
281 aa  56.6  5e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  27.72 
 
 
281 aa  56.6  5e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  28.1 
 
 
260 aa  56.6  5e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  25.1 
 
 
280 aa  56.2  6e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 
305 aa  55.8  8e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  31.78 
 
 
301 aa  55.5  9e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  5.92722e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  31.78 
 
 
301 aa  55.5  9e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  5.12138e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  31.78 
 
 
301 aa  55.5  9e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  6.63837e-07 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  28.57 
 
 
287 aa  55.5  9e-07  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  31.01 
 
 
300 aa  55.5  1e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  8.80779e-05  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  28.07 
 
 
299 aa  55.5  1e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  29.57 
 
 
318 aa  54.7  2e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  30 
 
 
280 aa  54.3  2e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  27.72 
 
 
271 aa  53.9  3e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  26.63 
 
 
279 aa  53.5  4e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  30.19 
 
 
268 aa  53.5  4e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  29.95 
 
 
267 aa  53.5  4e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  27.8 
 
 
311 aa  53.1  5e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1910  putative Flp pilus assembly protein CpaB  26.07 
 
 
274 aa  52.8  6e-06  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0558  putative Flp pilus assembly protein CpaB  26.07 
 
 
274 aa  52.8  6e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1513  hypothetical protein  29.82 
 
 
309 aa  52.8  6e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  28.27 
 
 
332 aa  52.8  7e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  28.95 
 
 
342 aa  52.8  7e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  26.7 
 
 
283 aa  52.4  9e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  26.22 
 
 
262 aa  52.4  9e-06  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0795  Flp pilus assembly protein CpaB  30.27 
 
 
390 aa  52.4  9e-06  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  27.5 
 
 
313 aa  51.6  1e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  1.43429e-05 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  27.5 
 
 
307 aa  51.2  2e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  26.41 
 
 
275 aa  50.8  2e-05  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  27.5 
 
 
307 aa  51.2  2e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  30 
 
 
307 aa  50.8  3e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  32.58 
 
 
309 aa  50.8  3e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  29.3 
 
 
271 aa  50.8  3e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  34.33 
 
 
301 aa  50.8  3e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02596  signal peptide protein  31.72 
 
 
208 aa  50.4  3e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818766 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0309  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  25.52 
 
 
274 aa  50.8  3e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  27.45 
 
 
322 aa  50.1  4e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0305  SAF domain-containing protein  29.55 
 
 
309 aa  49.7  5e-05  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  27.24 
 
 
319 aa  49.7  5e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>