More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2648 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  57.79 
 
 		 721 aa  902    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  57.03 
 
 		 731 aa  816    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.58 
 
 		 719 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3777  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.53 
 
 		 722 aa  798    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 769 aa  1547    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4151  DNA polymerase III, epsilon subunit  54.46 
 
 		 729 aa  770    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.86 
 
 		 706 aa  594  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  37.48 
 
 		 707 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  39.74 
 
 		 729 aa  325  3e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  33.53 
 
 		 719 aa  322  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  31.1 
 
 		 714 aa  300  6e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  41.62 
 
 		 616 aa  249  9e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  29.94 
 
 		 695 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.78 
 
 		 695 aa  238  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.14 
 
 		 695 aa  236  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3559  DNA polymerase III subunit epsilon  50.97 
 
 		 485 aa  211  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.21 
 
 		 659 aa  186  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3669  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.8 
 
 		 479 aa  182  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.731231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  36.2 
 
 		 1442 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  38.5 
 
 		 1440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  39.11 
 
 		 1407 aa  140  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  37.69 
 
 		 1367 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  37.69 
 
 		 1367 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  33.33 
 
 		 1433 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  36.13 
 
 		 1465 aa  130  8.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  40.43 
 
 		 1390 aa  130  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1848  DNA-directed DNA polymerase  40.32 
 
 		 233 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  39.62 
 
 		 1449 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  35.86 
 
 		 1447 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1567  DNA-directed DNA polymerase  41.05 
 
 		 236 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  38.99 
 
 		 1449 aa  127  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0424  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.95 
 
 		 186 aa  124  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0439  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.95 
 
 		 186 aa  124  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  35.2 
 
 		 1433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  35.2 
 
 		 1433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  31 
 
 		 1435 aa  122  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.46 
 
 		 180 aa  122  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  35.75 
 
 		 1421 aa  122  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  34.64 
 
 		 970 aa  120  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  34.64 
 
 		 1433 aa  120  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.44 
 
 		 595 aa  120  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  34.64 
 
 		 1433 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  34.64 
 
 		 1433 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  35.83 
 
 		 1527 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.5 
 
 		 498 aa  120  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  34.08 
 
 		 1433 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  34.08 
 
 		 1433 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  34.08 
 
 		 1433 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  38.89 
 
 		 315 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  34.08 
 
 		 1433 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  35.2 
 
 		 1433 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0478  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.46 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  38.5 
 
 		 315 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  36.72 
 
 		 1402 aa  117  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  38.89 
 
 		 315 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  35.14 
 
 		 1365 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  35.52 
 
 		 1397 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2003  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.58 
 
 		 247 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  40 
 
 		 315 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  36.18 
 
 		 1388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  40 
 
 		 315 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  37.89 
 
 		 217 aa  115  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.68 
 
 		 610 aa  115  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  38.17 
 
 		 1362 aa  114  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  39.39 
 
 		 315 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  39.39 
 
 		 315 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  35.2 
 
 		 1444 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  34.62 
 
 		 1436 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  38 
 
 		 590 aa  114  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.88 
 
 		 944 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  36.41 
 
 		 570 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.46 
 
 		 565 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  39.39 
 
 		 315 aa  112  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  38.79 
 
 		 315 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  39.39 
 
 		 315 aa  112  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.81 
 
 		 921 aa  112  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  35.91 
 
 		 1426 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  38.59 
 
 		 551 aa  111  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  34.44 
 
 		 1438 aa  110  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  34.44 
 
 		 1438 aa  110  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.39 
 
 		 236 aa  110  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  35.87 
 
 		 578 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  35.15 
 
 		 239 aa  108  3e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  38.18 
 
 		 560 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  36.42 
 
 		 1468 aa  108  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.35 
 
 		 237 aa  108  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1339  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.8 
 
 		 201 aa  108  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0133405  hitchhiker  0.000000000461521 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.76 
 
 		 235 aa  108  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.15 
 
 		 205 aa  108  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02830  hypothetical protein  36.99 
 
 		 204 aa  107  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.58 
 
 		 229 aa  107  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  38.65 
 
 		 299 aa  107  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  37.58 
 
 		 229 aa  107  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.5 
 
 		 631 aa  107  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  36.22 
 
 		 630 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  34.15 
 
 		 645 aa  105  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1445  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.94 
 
 		 214 aa  105  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000779612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  37.82 
 
 		 584 aa  104  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  34.29 
 
 		 1464 aa  104  5e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.6 
 
 		 584 aa  104  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>