More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2389 on replicon NC_011667
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011667  Tmz1t_2389  heavy metal sensor kinase  100 
 
 
445 aa  885  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0021647  normal  0.121803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2102  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
445 aa  885  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2216  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  53.17 
 
 
457 aa  433  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1630  putative two-component sensor  54.82 
 
 
453 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0454347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3560  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  49.66 
 
 
444 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0861327  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1092  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  52.51 
 
 
464 aa  388  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1712  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  48.42 
 
 
462 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 
458 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1306  heavy metal sensor histidine kinase  43.63 
 
 
454 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  43.63 
 
 
454 aa  239  6e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
463 aa  239  8e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4664  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.14 
 
 
454 aa  239  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0247649  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  38.67 
 
 
473 aa  234  2e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  46.64 
 
 
481 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0835  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 
465 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436383  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2068  heavy metal sensor signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.27 
 
 
484 aa  232  8e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178003  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4392  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
470 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
458 aa  226  5e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
480 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  37.24 
 
 
443 aa  222  1e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6518  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.04 
 
 
484 aa  220  4e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5872  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
485 aa  220  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617315  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4316  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 
485 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.500539 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3707  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.9 
 
 
482 aa  217  3e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 
482 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0670808  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  36.18 
 
 
443 aa  215  1e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
468 aa  214  3e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
468 aa  214  3e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
468 aa  214  3e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2193  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 
461 aa  212  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2481  heavy metal sensor histidine kinase  42.69 
 
 
461 aa  212  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.21939e-06  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
461 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4289  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 
494 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3228  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 
494 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8274  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
480 aa  210  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  35.37 
 
 
431 aa  209  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4077  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 
494 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2085  heavy metal sensor histidine kinase  42.4 
 
 
461 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.57758e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1730  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 
479 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
467 aa  207  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
474 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  30.7 
 
 
483 aa  206  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
469 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
462 aa  206  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  32.26 
 
 
476 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
476 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
458 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  31.65 
 
 
463 aa  204  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
468 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
467 aa  201  2e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  36.74 
 
 
484 aa  198  1e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.29 
 
 
471 aa  198  2e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  36.74 
 
 
436 aa  198  2e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  36.74 
 
 
484 aa  198  2e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  43.33 
 
 
446 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
467 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
450 aa  197  4e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
445 aa  197  5e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
477 aa  196  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
475 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
460 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 
481 aa  192  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  28.54 
 
 
482 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  28.48 
 
 
480 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  28.54 
 
 
482 aa  191  3e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
481 aa  191  3e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  28.48 
 
 
482 aa  190  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
480 aa  190  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
467 aa  189  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
449 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  28.32 
 
 
482 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  28.26 
 
 
475 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  28.26 
 
 
482 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
450 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
474 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  29.82 
 
 
464 aa  186  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
474 aa  186  1e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
474 aa  186  1e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
474 aa  185  1e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
460 aa  186  1e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
468 aa  185  1e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.33 
 
 
469 aa  185  2e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
462 aa  184  4e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  35.5 
 
 
459 aa  183  4e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
461 aa  183  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  40.66 
 
 
465 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  33.09 
 
 
460 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  40.21 
 
 
466 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  30.28 
 
 
464 aa  181  3e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  30.28 
 
 
464 aa  181  3e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  30.28 
 
 
464 aa  181  3e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  30.28 
 
 
464 aa  181  3e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.53 
 
 
466 aa  181  3e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  37.84 
 
 
470 aa  181  3e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  30.28 
 
 
464 aa  181  3e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  30.28 
 
 
464 aa  181  3e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 
487 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  39.37 
 
 
462 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  42.01 
 
 
463 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 
486 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>