More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2368 on replicon NC_011667
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  100 
 
 
223 aa  450  1e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  1.41034e-06  decreased coverage  1.17936e-09 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  54.12 
 
 
208 aa  211  6e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  37.31 
 
 
217 aa  147  1e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4198  resolvase domain-containing protein  40.1 
 
 
205 aa  143  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163134 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08249  site-specific recombinase  45.11 
 
 
135 aa  126  2e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  35.03 
 
 
203 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  33.16 
 
 
211 aa  122  4e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0864  multiple promoter invertase  32.83 
 
 
206 aa  117  1e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  34.2 
 
 
206 aa  116  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1950  multiple promoter invertase  36.22 
 
 
202 aa  109  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202011  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  30.24 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  29.08 
 
 
200 aa  89  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  4.21132e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2852  resolvase domain-containing protein  44.79 
 
 
183 aa  85.9  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.049445  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0013  DNA integration/recombination/inversion protein  51.85 
 
 
98 aa  84  2e-15  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.52034  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  33.33 
 
 
212 aa  80.1  2e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  35.42 
 
 
184 aa  76.6  3e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  32.29 
 
 
191 aa  76.6  3e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  31.63 
 
 
191 aa  74.7  1e-12  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  31.77 
 
 
192 aa  74.3  2e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  31.77 
 
 
192 aa  74.3  2e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  30.48 
 
 
198 aa  73.6  3e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  32.62 
 
 
185 aa  72.8  3e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  29.23 
 
 
190 aa  71.2  1e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  32.28 
 
 
183 aa  70.5  2e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  29.02 
 
 
199 aa  69.3  5e-11  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  31.25 
 
 
191 aa  69.3  5e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  31.12 
 
 
193 aa  68.2  1e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 
193 aa  68.2  1e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  28.12 
 
 
198 aa  67.4  1e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  31.31 
 
 
189 aa  67  2e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  31.31 
 
 
189 aa  67  2e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  27.46 
 
 
181 aa  67  2e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  32.04 
 
 
198 aa  66.6  3e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  27.6 
 
 
201 aa  66.2  3e-10  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  6.03181e-09 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  30.19 
 
 
209 aa  66.2  4e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  29.69 
 
 
197 aa  66.2  4e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  29.17 
 
 
222 aa  65.9  5e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  26.8 
 
 
181 aa  65.1  8e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1967  resolvase domain-containing protein  33.96 
 
 
252 aa  65.1  8e-10  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  29.38 
 
 
179 aa  65.1  9e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  32.28 
 
 
181 aa  64.3  1e-09  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  30.1 
 
 
197 aa  64.7  1e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  30.1 
 
 
197 aa  64.7  1e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  31.28 
 
 
192 aa  64.3  1e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  7.70175e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  29.9 
 
 
195 aa  63.9  2e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  30.1 
 
 
217 aa  63.5  2e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  29.17 
 
 
191 aa  63.9  2e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  26.57 
 
 
202 aa  63.2  3e-09  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  29.08 
 
 
192 aa  63.2  3e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  27.08 
 
 
183 aa  63.2  3e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  28.79 
 
 
184 aa  63.5  3e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  28.37 
 
 
235 aa  63.2  3e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1181  resolvase domain-containing protein  27.05 
 
 
208 aa  63.2  3e-09  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0644392 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  30.1 
 
 
197 aa  62.8  4e-09  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  29.32 
 
 
185 aa  62.4  5e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  29.32 
 
 
185 aa  62.4  5e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  28.79 
 
 
205 aa  62.4  6e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  28.04 
 
 
180 aa  62.4  6e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  27.55 
 
 
188 aa  62  7e-09  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  28.27 
 
 
196 aa  62  8e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  28.28 
 
 
188 aa  61.6  8e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  29.15 
 
 
197 aa  61.6  8e-09  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  28.27 
 
 
185 aa  61.6  1e-08  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  28.72 
 
 
181 aa  61.2  1e-08  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.26 
 
 
201 aa  61.2  1e-08  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  28.57 
 
 
186 aa  61.2  1e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  27.41 
 
 
189 aa  61.6  1e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  26.9 
 
 
186 aa  61.2  1e-08  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  28.57 
 
 
186 aa  61.2  1e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  29.84 
 
 
181 aa  60.8  2e-08  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  30.26 
 
 
185 aa  60.8  2e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  28.28 
 
 
185 aa  60.8  2e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  27.41 
 
 
186 aa  60.5  2e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  28.28 
 
 
185 aa  60.8  2e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0876  resolvase domain-containing protein  32.7 
 
 
251 aa  60.1  2e-08  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0740279  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  28.28 
 
 
185 aa  60.8  2e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  28.28 
 
 
185 aa  60.8  2e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  25.91 
 
 
184 aa  59.7  4e-08  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  29.17 
 
 
186 aa  59.7  4e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  31.33 
 
 
196 aa  59.3  4e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  28.35 
 
 
190 aa  59.7  4e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  31.33 
 
 
196 aa  59.3  4e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  31.33 
 
 
196 aa  59.3  4e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  29.74 
 
 
185 aa  58.9  5e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  30.93 
 
 
188 aa  59.3  5e-08  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  27.62 
 
 
196 aa  58.9  6e-08  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  29.73 
 
 
194 aa  58.9  6e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  26.94 
 
 
190 aa  58.5  7e-08  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  1.41759e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  27.66 
 
 
189 aa  58.5  8e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  26.67 
 
 
183 aa  58.2  9e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  29.38 
 
 
179 aa  58.5  9e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  26.67 
 
 
183 aa  58.2  9e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  28.27 
 
 
290 aa  58.5  9e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  29.95 
 
 
187 aa  58.2  1e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  28.08 
 
 
231 aa  57.8  1e-07  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  27.78 
 
 
185 aa  58.2  1e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  27.69 
 
 
190 aa  57.8  1e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  31.77 
 
 
181 aa  58.2  1e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  29.1 
 
 
188 aa  57.8  1e-07  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  9.77256e-05 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  25.89 
 
 
186 aa  57  2e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  3.21893e-05  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>