31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2211 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2211  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  302  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  59.44 
 
 
147 aa  177  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  51.37 
 
 
146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  41.78 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  38.89 
 
 
149 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  38.89 
 
 
149 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  39.72 
 
 
150 aa  100  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  36.23 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  35.61 
 
 
148 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  34.59 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  32.61 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  34.78 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  32.03 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1048  hypothetical protein  40.57 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0125  hypothetical protein  30.41 
 
 
144 aa  67  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  26.92 
 
 
184 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3367  hypothetical protein  29.93 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  25.33 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3010  hypothetical protein  25.33 
 
 
152 aa  50.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729509  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  29.85 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  27.86 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  23.94 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  23.94 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  27.66 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  24 
 
 
172 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  24.82 
 
 
155 aa  47.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6901  hypothetical protein  23.85 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984324  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  30.95 
 
 
148 aa  43.5  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3609  hypothetical protein  24.37 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3881  hypothetical protein  27.4 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  0.573766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  27.21 
 
 
149 aa  40.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>