92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2148 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
96 aa  184  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  96.88 
 
 
96 aa  181  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  88.54 
 
 
96 aa  168  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  72.92 
 
 
96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  65.62 
 
 
96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0168  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  77.08 
 
 
96 aa  124  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.172039  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0017  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  77.08 
 
 
96 aa  124  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.378069  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0012  DNA polymerase, beta-like region  90.7 
 
 
88 aa  123  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0162009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2046  hypothetical protein  65.05 
 
 
135 aa  117  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408644  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  60 
 
 
98 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  55.21 
 
 
96 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 
96 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  51.04 
 
 
96 aa  91.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1652  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  57.97 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  42.86 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  40.91 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  42.86 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  42.39 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1512  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  32.29 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0340826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  42.53 
 
 
93 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 
169 aa  60.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 
152 aa  60.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  56.52 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 
100 aa  57  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  38.96 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  39.56 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  38.95 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  39.33 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  43.24 
 
 
114 aa  55.1  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  40.23 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  38.04 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 
97 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  33.68 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  36.26 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  37.63 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  35.56 
 
 
131 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 
98 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  37.89 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  39.19 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26330  predicted nucleotidyltransferase  39.13 
 
 
121 aa  50.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155672  normal  0.055633 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  32.67 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  34.62 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  32.67 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  38.03 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  36.49 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  31.82 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  36.49 
 
 
113 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  36.14 
 
 
115 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  34.02 
 
 
99 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 
97 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1345  DNA polymerase, beta-like region  49.02 
 
 
55 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  37.97 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  33.33 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  34.78 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  30.11 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  35.9 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  37.35 
 
 
102 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  35.62 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  36.49 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  29.67 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  35.44 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  29.67 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  38.27 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  26.92 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  38.89 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  36.25 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19940  predicted nucleotidyltransferase  44.44 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0104125 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  30.38 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  32.47 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  40.91 
 
 
254 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  32.58 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  32.26 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  38.64 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  30.38 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  38.67 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  36.78 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  27.08 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  36 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  28.4 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  28.4 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  32.58 
 
 
94 aa  40.4  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  35.82 
 
 
104 aa  40.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 
103 aa  40.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  38.75 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  27.08 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  30.77 
 
 
95 aa  40  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>