30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2084 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2084  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  909    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0757382  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_50  hypothetical protein  42.62 
 
 
424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00190835  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2331  hypothetical protein  40.88 
 
 
423 aa  319  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122664  hitchhiker  0.0000000213226 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0752  hypothetical protein  39.95 
 
 
428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194226 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1515  hypothetical protein  45.21 
 
 
293 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.107108  hitchhiker  0.0038288 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0384  hypothetical protein  44.86 
 
 
293 aa  247  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.288726 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1034  hypothetical protein  41.1 
 
 
292 aa  207  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0945  hypothetical protein  31.34 
 
 
423 aa  206  6e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523813  n/a   
 
 
 
NC_013165  Shel_02900  hypothetical protein  42.32 
 
 
296 aa  206  6e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00646507  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1036  hypothetical protein  34.27 
 
 
294 aa  167  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1803  hypothetical protein  27.02 
 
 
454 aa  70.5  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1832  hypothetical protein  23.54 
 
 
442 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539757  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4350  hypothetical protein  30.87 
 
 
510 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.278598  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7308  hypothetical protein  25.17 
 
 
288 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000749019  hitchhiker  0.0000983885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6926  DNA polymerase beta domain protein region  23.96 
 
 
293 aa  56.6  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000143596  hitchhiker  0.000343004 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1739  hypothetical protein  24.83 
 
 
358 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2822  hypothetical protein  20.79 
 
 
449 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.816333  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1233  hypothetical protein  21.97 
 
 
283 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5161  hypothetical protein  25.47 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0502601  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3225  hypothetical protein  36.36 
 
 
485 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2233  hypothetical protein  24.84 
 
 
309 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000107793  hitchhiker  0.00000113425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2340  hypothetical protein  21.27 
 
 
300 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000406719  unclonable  0.000000155562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1270  hypothetical protein  20.26 
 
 
300 aa  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1829  hypothetical protein  21.17 
 
 
298 aa  47  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660383  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3186  hypothetical protein  22.84 
 
 
337 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3236  hypothetical protein  22.84 
 
 
337 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3174  hypothetical protein  22.84 
 
 
337 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3227  hypothetical protein  28.57 
 
 
490 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06330  hypothetical protein  20.5 
 
 
330 aa  43.9  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2454  hypothetical protein  22.76 
 
 
323 aa  43.9  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000139037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>