120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1917 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  85.04 
 
 
401 aa  697    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  85.04 
 
 
401 aa  699    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  85.04 
 
 
401 aa  699    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  83.04 
 
 
401 aa  685    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  85.04 
 
 
401 aa  699    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  84.54 
 
 
401 aa  691    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  82.25 
 
 
399 aa  653    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  82.5 
 
 
399 aa  655    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  84.79 
 
 
401 aa  697    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  81.55 
 
 
401 aa  643    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
401 aa  795    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  76.12 
 
 
401 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  77.56 
 
 
399 aa  592  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  74.31 
 
 
397 aa  588  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  71.32 
 
 
397 aa  571  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  72.32 
 
 
400 aa  553  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  70.32 
 
 
400 aa  551  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  74.31 
 
 
400 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  72.2 
 
 
406 aa  537  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  70.57 
 
 
397 aa  533  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  72.57 
 
 
400 aa  531  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  72.07 
 
 
397 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  43.1 
 
 
400 aa  305  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  41.58 
 
 
400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  39.4 
 
 
381 aa  297  3e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  43.18 
 
 
399 aa  282  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  42.57 
 
 
400 aa  279  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  37.99 
 
 
400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  37.09 
 
 
377 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  39.36 
 
 
380 aa  249  8e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  36.59 
 
 
397 aa  243  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  34 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  24.63 
 
 
349 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  22.84 
 
 
407 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  22.33 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  22.76 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  22.46 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  22.33 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  22.46 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  22.22 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  27.64 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  22.95 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.98 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  22.3 
 
 
354 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  22.3 
 
 
354 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  22.2 
 
 
354 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  25.41 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  24.44 
 
 
349 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  21.24 
 
 
392 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  25.18 
 
 
377 aa  63.5  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  21.81 
 
 
349 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  21.81 
 
 
349 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  21.13 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  23.22 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  29.26 
 
 
381 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 
382 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  32.28 
 
 
362 aa  56.6  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  28.93 
 
 
356 aa  56.2  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  22.27 
 
 
402 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  32.17 
 
 
376 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  30 
 
 
443 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  30.65 
 
 
378 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25 
 
 
411 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  26.28 
 
 
350 aa  50.4  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  35.4 
 
 
380 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  24.71 
 
 
384 aa  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.46 
 
 
809 aa  49.7  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  27.27 
 
 
389 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  25.93 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  25.29 
 
 
385 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  22.17 
 
 
389 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  30.58 
 
 
452 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  28.91 
 
 
393 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  22.14 
 
 
400 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.71 
 
 
420 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  18.07 
 
 
350 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  26.74 
 
 
397 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.91 
 
 
416 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  32.74 
 
 
380 aa  47  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.34 
 
 
417 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  22.86 
 
 
352 aa  47  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  24.86 
 
 
397 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 
378 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  26.67 
 
 
385 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  31.37 
 
 
410 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 
378 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  31.58 
 
 
378 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 
378 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 
378 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 
378 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  26.29 
 
 
855 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  26.61 
 
 
859 aa  46.2  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  23.11 
 
 
838 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  27.93 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  31.17 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  27.17 
 
 
385 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  29.9 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  36.49 
 
 
399 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  28.87 
 
 
411 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  25.85 
 
 
351 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>