165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1800 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
549 aa  1072    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  43.69 
 
 
546 aa  371  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.6 
 
 
563 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.98 
 
 
565 aa  360  4e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.78 
 
 
549 aa  356  7.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  41.03 
 
 
563 aa  353  4e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.82 
 
 
560 aa  352  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.08 
 
 
566 aa  332  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  42.32 
 
 
530 aa  330  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.93 
 
 
560 aa  320  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.3 
 
 
559 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  32.65 
 
 
571 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.13 
 
 
560 aa  286  9e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.88 
 
 
560 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.67 
 
 
560 aa  273  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  37.01 
 
 
537 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  35.89 
 
 
563 aa  265  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.15 
 
 
526 aa  261  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  34.81 
 
 
598 aa  257  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  34.32 
 
 
606 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.71 
 
 
547 aa  249  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  33.91 
 
 
615 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  33.91 
 
 
615 aa  248  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.21 
 
 
544 aa  248  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.19 
 
 
556 aa  246  9e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  33.72 
 
 
615 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  33.72 
 
 
615 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  33.72 
 
 
615 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.72 
 
 
615 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  33.46 
 
 
616 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  33.72 
 
 
615 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  33.72 
 
 
615 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  33.72 
 
 
615 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  35.7 
 
 
564 aa  244  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  33.07 
 
 
611 aa  244  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  33.72 
 
 
615 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  39.77 
 
 
575 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  33.53 
 
 
615 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  39.37 
 
 
576 aa  239  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  33.15 
 
 
607 aa  239  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  35.56 
 
 
536 aa  237  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  39.77 
 
 
563 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  28.51 
 
 
568 aa  233  7.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  41.18 
 
 
613 aa  229  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  33.39 
 
 
554 aa  226  7e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
549 aa  226  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  32.61 
 
 
546 aa  226  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.61 
 
 
546 aa  226  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003127  L,D-transpeptidase YcbB  41.26 
 
 
513 aa  224  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00544147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.34 
 
 
500 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  40.77 
 
 
618 aa  223  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  40.77 
 
 
618 aa  223  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02710  hypothetical protein  39.61 
 
 
530 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  40.77 
 
 
596 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1889  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.84 
 
 
558 aa  220  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.362103 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  30.1 
 
 
811 aa  219  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1327  hypothetical protein  37.99 
 
 
512 aa  219  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.592833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.8 
 
 
599 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2146  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.54 
 
 
558 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.582459  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.91 
 
 
521 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1924  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.91 
 
 
521 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0712521  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.59 
 
 
535 aa  216  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  35.67 
 
 
419 aa  216  9e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.57 
 
 
540 aa  216  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.61 
 
 
521 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0887  hypothetical protein  32.57 
 
 
524 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102683  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  27.59 
 
 
558 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.9 
 
 
716 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.65 
 
 
775 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1223  hypothetical protein  40.5 
 
 
318 aa  213  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2109  hypothetical protein  35.58 
 
 
502 aa  213  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.87 
 
 
525 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315438  normal  0.0441683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1428  hypothetical protein  31.15 
 
 
718 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1892  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.01 
 
 
484 aa  212  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.313593  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.91 
 
 
458 aa  211  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.21 
 
 
525 aa  210  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.56 
 
 
625 aa  209  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1831  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.12 
 
 
542 aa  209  9e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.809625 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  35.43 
 
 
557 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.5 
 
 
473 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.31 
 
 
724 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.74 
 
 
433 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.58 
 
 
531 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.89 
 
 
629 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.54 
 
 
506 aa  206  8e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1615  cell wall degradation protein  34.27 
 
 
513 aa  206  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.12409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.29 
 
 
443 aa  205  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.66 
 
 
399 aa  205  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.56 
 
 
602 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.44 
 
 
533 aa  204  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6595  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.34 
 
 
553 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.775034 
 
 
-
 
NC_004310  BR0762  peptidoglycan-binding protein, putative  34.83 
 
 
433 aa  204  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0757  putative peptidoglycan-binding protein  34.83 
 
 
446 aa  204  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2451  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.2 
 
 
465 aa  204  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000544854  normal  0.511504 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  33.41 
 
 
540 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1789  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.55 
 
 
571 aa  201  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.385253  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1957  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.33 
 
 
451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.732042  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3977  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.11 
 
 
730 aa  200  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.52 
 
 
461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179987  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5373  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.43 
 
 
432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.018729  normal  0.0376444 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>