132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1790 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1790  CreA family protein  100 
 
 
172 aa  344  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0634  CreA family protein  70.59 
 
 
168 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265894  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0655  CreA family protein  69.85 
 
 
168 aa  209  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2219  CreA family protein  68.79 
 
 
167 aa  208  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.733419  normal  0.0172674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4988  CreA family protein  69.06 
 
 
178 aa  208  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109414  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3982  CreA family protein  66.91 
 
 
168 aa  202  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2794  CreA protein  62 
 
 
157 aa  201  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.610019  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2016  CreA family protein  68.38 
 
 
168 aa  198  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4747  hypothetical protein  62.5 
 
 
158 aa  195  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4041  CreA  62.59 
 
 
157 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1715  CreA  59.26 
 
 
163 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.842807  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5711  CreA family protein  63.04 
 
 
169 aa  191  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0147337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4493  CreA family protein  61.81 
 
 
153 aa  190  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.105025  normal  0.313164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0724  CreA family protein  62.5 
 
 
153 aa  190  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0692  CreA family protein  62.69 
 
 
153 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0724  CreA family protein  62.69 
 
 
153 aa  187  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.0462373 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0326  CreA  57.34 
 
 
156 aa  184  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.884281  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2475  CreA family protein  57.14 
 
 
154 aa  184  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227158  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1356  CreA family protein  57.33 
 
 
159 aa  184  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389056  normal  0.0606126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1471  putative CREA signal peptide protein  55.35 
 
 
169 aa  184  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  0.156186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4856  CreA  63.28 
 
 
154 aa  183  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1693  creA protein  59.35 
 
 
160 aa  181  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1050  hypothetical protein  59.71 
 
 
158 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013058  normal  0.385913 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2205  CreA family protein  57.76 
 
 
160 aa  182  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571035  normal  0.349002 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1420  CreA family protein  59.57 
 
 
159 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136825  normal  0.374337 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0506  creA protein  62.59 
 
 
159 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405365  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2935  CreA protein  62.59 
 
 
159 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000238483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2506  creA protein  62.59 
 
 
159 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020214  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2818  CreA protein  62.59 
 
 
159 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000698436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2878  CreA protein  62.59 
 
 
159 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00867181  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4211  hypothetical protein  61.03 
 
 
161 aa  180  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728234  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0619  CreA  60.29 
 
 
161 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000154449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60410  hypothetical protein  62.99 
 
 
154 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117962 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1098  CreA family protein  60.29 
 
 
161 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3678  CreA family protein  62.2 
 
 
152 aa  179  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5204  hypothetical protein  62.99 
 
 
154 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146479  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1057  CreA family protein  60.29 
 
 
161 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000059839  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0978  CreA family protein  60.29 
 
 
161 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590297  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0974  CreA family protein  60.29 
 
 
161 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2934  CreA family protein  59.12 
 
 
158 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134682  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2776  creA protein  61.87 
 
 
159 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1829  CreA protein  61.87 
 
 
159 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0705  CreA  55.63 
 
 
156 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0801  creA protein  54.42 
 
 
156 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0806  CreA family protein  58.57 
 
 
167 aa  175  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.327606 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0789  CreA family protein  55.1 
 
 
164 aa  172  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000658156  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40750  CreA family protein  60.63 
 
 
150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3479  hypothetical protein  51.7 
 
 
155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0812  hypothetical protein  51.7 
 
 
155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3607  hypothetical protein  51.7 
 
 
155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3672  hypothetical protein  54.36 
 
 
160 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0530  hypothetical protein  55.1 
 
 
158 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4838  hypothetical protein  54.55 
 
 
162 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4997  hypothetical protein  54.55 
 
 
162 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.820567 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4999  hypothetical protein  54.55 
 
 
162 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04273  hypothetical protein  57.04 
 
 
157 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3600  CreA family protein  57.04 
 
 
157 aa  166  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0558  hypothetical protein  53.85 
 
 
156 aa  166  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4911  hypothetical protein  54.55 
 
 
157 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5912  hypothetical protein  57.04 
 
 
157 aa  166  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04238  hypothetical protein  57.04 
 
 
157 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4633  hypothetical protein  57.04 
 
 
157 aa  166  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4996  hypothetical protein  57.04 
 
 
157 aa  166  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0569  hypothetical protein  54.81 
 
 
161 aa  166  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3659  hypothetical protein  57.04 
 
 
157 aa  166  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4948  hypothetical protein  57.04 
 
 
157 aa  166  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4945  hypothetical protein  54.55 
 
 
157 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4945  hypothetical protein  57.04 
 
 
157 aa  166  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3866  hypothetical protein  52.35 
 
 
160 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000248157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0680  hypothetical protein  54.48 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000479478  normal  0.515655 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2083  CreA  55.91 
 
 
155 aa  157  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1905  CreA  50.35 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5569  CreA family protein  48.97 
 
 
170 aa  148  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1237  CreA family protein  53.6 
 
 
179 aa  143  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.074293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3447  CreA family protein  54.17 
 
 
182 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5289  CreA family protein  51.67 
 
 
181 aa  141  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2379  CreA family protein  47.3 
 
 
161 aa  140  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248608  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4747  CreA family protein  50.83 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00543414  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5214  CreA family protein  50.83 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.304465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0457  CreA family protein  47.37 
 
 
166 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.931999  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2345  CreA  51.67 
 
 
180 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00745568  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3882  hypothetical protein  44.72 
 
 
183 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.391331 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2502  CreA  49.22 
 
 
182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1583  CreA  42.24 
 
 
186 aa  135  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38703  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2105  CreA  44.38 
 
 
187 aa  135  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0133  CreA family protein  44.74 
 
 
176 aa  134  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1640  CreA family protein  44.65 
 
 
173 aa  134  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2941  CreA  49.17 
 
 
182 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.518009  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4719  CreA family protein  51.67 
 
 
183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0777837  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3676  CreA family protein  49.17 
 
 
180 aa  124  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000448514  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0026  CreA family protein  43.84 
 
 
155 aa  121  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2014  CreA family protein  38.46 
 
 
151 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418182  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3321  CreA family protein  36.49 
 
 
151 aa  91.3  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2576  CreA family protein  36 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.474356  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1167  CreA family protein  37.67 
 
 
150 aa  85.1  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.538794  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2505  CreA family protein  37.76 
 
 
186 aa  84.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2837  CreA family protein  37.14 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.542639  hitchhiker  0.00948652 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2864  hypothetical protein  38.13 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2655  CreA family protein  39.13 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.546871  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1146  CreA family protein  31.33 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247181  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>