220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1711 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  77.39 
 
 
398 aa  662    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  93.97 
 
 
398 aa  776    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  100 
 
 
398 aa  821    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  60.49 
 
 
404 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  59.95 
 
 
398 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  59.22 
 
 
407 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  58.98 
 
 
407 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  58.98 
 
 
407 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  57.46 
 
 
411 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  58.01 
 
 
428 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  59.15 
 
 
409 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  58.5 
 
 
411 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  58.5 
 
 
406 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  56.97 
 
 
411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  58.5 
 
 
407 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  56.69 
 
 
409 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  59.55 
 
 
401 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  57.58 
 
 
406 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  58.04 
 
 
404 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  58.5 
 
 
408 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  57.75 
 
 
407 aa  435  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  54.43 
 
 
405 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  56.64 
 
 
430 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  54.43 
 
 
405 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  57.29 
 
 
404 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  56.61 
 
 
407 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  54.43 
 
 
405 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  55.8 
 
 
409 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  54.63 
 
 
408 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  54.63 
 
 
408 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  55.53 
 
 
406 aa  426  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  54.63 
 
 
408 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  57 
 
 
412 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  54.63 
 
 
408 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  54.39 
 
 
408 aa  425  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  54.63 
 
 
408 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  54.39 
 
 
408 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  54.39 
 
 
408 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  53.9 
 
 
408 aa  419  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  55.25 
 
 
410 aa  418  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  54 
 
 
395 aa  388  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  52.33 
 
 
407 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  49.38 
 
 
393 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  53.79 
 
 
398 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  54.86 
 
 
399 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  52.97 
 
 
384 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  50.25 
 
 
393 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  52.78 
 
 
395 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  49.88 
 
 
393 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  51.96 
 
 
402 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  50.73 
 
 
395 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  48.95 
 
 
385 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  48.66 
 
 
397 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  48.21 
 
 
389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  49.75 
 
 
395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  49.15 
 
 
409 aa  349  4e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  47.92 
 
 
410 aa  346  5e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  47.41 
 
 
390 aa  345  8.999999999999999e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  47.79 
 
 
388 aa  344  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  46.63 
 
 
388 aa  341  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  47.54 
 
 
394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  49.09 
 
 
384 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  46.12 
 
 
407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  47.11 
 
 
715 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1675  protein of unknown function UPF0027  47.11 
 
 
715 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.445004  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  39.9 
 
 
396 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2130  hypothetical protein  38.24 
 
 
399 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549422  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  33.25 
 
 
372 aa  205  9e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  36.3 
 
 
463 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  29.67 
 
 
391 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  33.68 
 
 
462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  35.66 
 
 
473 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  34.99 
 
 
470 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0804  hypothetical protein  30.73 
 
 
375 aa  176  8e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.671535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  35.61 
 
 
470 aa  176  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  30.84 
 
 
443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0812  hypothetical protein  34.5 
 
 
391 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.217299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2736  hypothetical protein  29.74 
 
 
395 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000182015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  34.38 
 
 
475 aa  170  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3033  hypothetical protein  29.21 
 
 
395 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000141174  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  31.39 
 
 
480 aa  169  8e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0250  hypothetical protein  28.5 
 
 
396 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00470202  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  31.6 
 
 
480 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  33.51 
 
 
508 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3035  hypothetical protein  29.21 
 
 
395 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2787  hypothetical protein  28.21 
 
 
395 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.535488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2999  hypothetical protein  28.21 
 
 
395 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000593147  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  30.87 
 
 
480 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2997  hypothetical protein  28.74 
 
 
395 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000377658 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2717  hypothetical protein  28.74 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145401  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  31.09 
 
 
480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  32.33 
 
 
473 aa  166  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  33.82 
 
 
474 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  33.84 
 
 
484 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  32.41 
 
 
473 aa  161  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  32.74 
 
 
474 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  33.58 
 
 
474 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  31.24 
 
 
472 aa  160  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1375  protein of unknown function UPF0027  29.36 
 
 
405 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0018523  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  32.25 
 
 
484 aa  160  4e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>