More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1697 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1697  transcriptional regulator, TraR/DksA family  100 
 
 
141 aa  290  7e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  1.37678e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  78.72 
 
 
141 aa  241  2e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2552  TraR/DksA family transcriptional regulator  77.94 
 
 
140 aa  228  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0402144  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0072  TraR/DksA family transcriptional regulator  75.18 
 
 
140 aa  222  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  7.40961e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0691  TraR/DksA family transcriptional regulator  74.47 
 
 
139 aa  219  1e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0872386  normal  0.218793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0517  DnaK suppressor protein  68.7 
 
 
143 aa  194  4e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  66.67 
 
 
154 aa  190  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  66.67 
 
 
154 aa  190  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0276  TraR/DksA family transcriptional regulator  70.08 
 
 
143 aa  190  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5439  suppressor protein DksA  68.7 
 
 
148 aa  189  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62490  suppressor protein DksA  68.7 
 
 
148 aa  189  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42640  RNA polymerase binding protein DksA  64.49 
 
 
145 aa  188  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.105027  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4011  TraR/DksA family transcriptional regulator  60 
 
 
144 aa  186  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00055516  normal  0.87616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3585  TraR/DksA family transcriptional regulator  65.93 
 
 
148 aa  186  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.845772 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3060  TraR/DksA family transcriptional regulator  62.41 
 
 
145 aa  181  2e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0497831  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0149  RNA polymerase-binding transcription factor  64.34 
 
 
151 aa  179  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.31318e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0154  RNA polymerase-binding transcription factor  64.34 
 
 
151 aa  179  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0031107  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00143  hypothetical protein  64.34 
 
 
151 aa  179  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000224196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00144  DNA-binding transcriptional regulator of rRNA transcription, DnaK suppressor protein  64.34 
 
 
151 aa  179  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0136  RNA polymerase-binding transcription factor  64.34 
 
 
151 aa  179  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.00013e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0156  RNA polymerase-binding transcription factor  64.34 
 
 
151 aa  179  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000187582  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3514  RNA polymerase-binding transcription factor  64.34 
 
 
151 aa  179  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000935377  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0148  RNA polymerase-binding transcription factor  64.34 
 
 
151 aa  179  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.73463e-14  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3457  transcriptional regulator, TraR/DksA family  64.34 
 
 
151 aa  179  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.24053e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0995  TraR/DksA family transcriptional regulator  64.89 
 
 
144 aa  178  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2819  RNA polymerase-binding transcription factor  64.34 
 
 
151 aa  178  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.02941  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2605  DnaK suppressor protein  62.79 
 
 
156 aa  177  3e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.422006  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1032  RNA polymerase-binding transcription factor  64.34 
 
 
151 aa  177  5e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0218805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0674  TraR/DksA family transcriptional regulator  61.83 
 
 
146 aa  177  6e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0202  RNA polymerase-binding transcription factor  62.79 
 
 
151 aa  176  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210967  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0220  RNA polymerase-binding transcription factor  62.79 
 
 
151 aa  176  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.37551e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0203  RNA polymerase-binding transcription factor  62.79 
 
 
151 aa  176  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3372  TraR/DksA family transcriptional regulator  62.31 
 
 
145 aa  176  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.911345  normal  0.0274052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0218  RNA polymerase-binding transcription factor  62.79 
 
 
151 aa  176  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.236664  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0214  RNA polymerase-binding transcription factor  62.79 
 
 
151 aa  176  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.748319  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4804  TraR/DksA family transcriptional regulator  63.64 
 
 
147 aa  176  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  hitchhiker  0.00624661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0685  RNA polymerase-binding transcription factor  62.02 
 
 
151 aa  175  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0013378  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3985  RNA polymerase-binding transcription factor  61.24 
 
 
151 aa  174  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000239354  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1032  transcriptional regulator, TraR/DksA family  61.07 
 
 
151 aa  174  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.955703  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3468  RNA polymerase-binding transcription factor  61.24 
 
 
151 aa  174  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0312993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3114  RNA polymerase-binding transcription factor  62.02 
 
 
151 aa  174  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0231493  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3338  RNA polymerase-binding transcription factor  61.24 
 
 
151 aa  174  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.58197e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0835  hypothetical protein  62.12 
 
 
146 aa  173  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111035 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1164  RNA polymerase-binding transcription factor  62.02 
 
 
151 aa  173  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00894629  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3937  TraR/DksA family transcriptional regulator  60.16 
 
 
149 aa  173  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  1.39541e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1005  RNA polymerase-binding transcription factor  61.24 
 
 
182 aa  173  9e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.32792e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2037  regulator RpoS  61.54 
 
 
146 aa  172  1e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.555499  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0879  suppressor protein DksA  59.4 
 
 
145 aa  172  1e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0780  TraR/DksA family transcriptional regulator  61.24 
 
 
147 aa  172  2e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00166659  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0969  dnaK suppressor protein  62.12 
 
 
146 aa  172  2e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0480379  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  59.69 
 
 
150 aa  171  4e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0127  dnaK suppressor protein  60.94 
 
 
148 aa  171  4e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.95735e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2340  TraR/DksA family transcriptional regulator  60.77 
 
 
146 aa  170  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03545  putative DnaK suppressor protein  60.16 
 
 
152 aa  169  8e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  7.89924e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3129  TraR/DksA family transcriptional regulator  59.69 
 
 
147 aa  169  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.6681e-09  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4691  TraR/DksA family transcriptional regulator  61.54 
 
 
147 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.77976e-06 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2286  hypothetical protein  61.42 
 
 
143 aa  169  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2259  hypothetical protein  60.47 
 
 
143 aa  169  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03446  hypothetical protein  60.16 
 
 
148 aa  168  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3798  TraR/DksA family transcriptional regulator  59.69 
 
 
147 aa  169  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  3.88201e-07  hitchhiker  3.22165e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3490  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.91 
 
 
147 aa  167  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  8.69556e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3170  RNA polymerase-binding, DksA  59.69 
 
 
147 aa  168  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  4.3315e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0227  DnaK suppressor protein DksA  58.14 
 
 
151 aa  167  3e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.143062  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0874  DnaK suppressor protein  58.91 
 
 
147 aa  167  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0730  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.91 
 
 
147 aa  167  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  6.97807e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0180  TraR/DksA family transcriptional regulator  60.47 
 
 
144 aa  167  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  1.32063e-08  normal  0.0556483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3292  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.91 
 
 
147 aa  167  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  3.29302e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0849  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.91 
 
 
147 aa  167  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.07681e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0884  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.91 
 
 
147 aa  167  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  3.26518e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3128  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.91 
 
 
147 aa  167  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.88351e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0872  transcriptional regulator, TraR/DksA family  58.91 
 
 
147 aa  167  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.69398e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0741  TraR/DksA family transcriptional regulator  60.77 
 
 
147 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  5.3151e-09 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3899  TraR/DksA family transcriptional regulator  59.69 
 
 
147 aa  167  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.83088e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002565  C4-type zinc finger protein, DksA/TraR family  60.16 
 
 
148 aa  167  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.5142e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1023  DnaK suppressor protein  59.38 
 
 
136 aa  166  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4306  DnaK suppressor protein  60.47 
 
 
148 aa  165  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0698  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.14 
 
 
147 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.70209e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3404  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.36 
 
 
147 aa  164  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  4.37132e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0114  RNA polymerase-binding protein DksA  56.52 
 
 
147 aa  164  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  1.721e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  60 
 
 
148 aa  162  1e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195272  hitchhiker  4.57182e-06 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4693  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  60 
 
 
148 aa  162  1e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000772708 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2068  DnaK suppressor protein  55.71 
 
 
149 aa  159  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  1.91774e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3276  transcriptional regulators, TraR/DksA family protein  58.14 
 
 
147 aa  159  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  7.8623e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0584  RNA polymerase-binding dnaK suppressor protein DksA  57.36 
 
 
148 aa  157  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3295  TraR/DksA family transcriptional regulator  60.8 
 
 
155 aa  145  2e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013948  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1243  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.49 
 
 
142 aa  140  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0571  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.59 
 
 
134 aa  126  1e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2297  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.74 
 
 
141 aa  123  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0340464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.6 
 
 
159 aa  122  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2993  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 
223 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0808  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 
165 aa  120  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  49.6 
 
 
157 aa  120  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.8 
 
 
158 aa  120  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3835  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.15 
 
 
162 aa  120  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.827568 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1064  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.31 
 
 
450 aa  120  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  52.14 
 
 
118 aa  120  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  2.02655e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3683  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 
281 aa  120  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1457  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.74 
 
 
164 aa  119  1e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.969843  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0509  transcriptional regulator, TraR/DksA family  49.61 
 
 
138 aa  119  1e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.31 
 
 
257 aa  119  1e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>