253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1652 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2767  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  74.84 
 
 
465 aa  691  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1652  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  100 
 
 
471 aa  935  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000557684  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  69.28 
 
 
482 aa  651  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7227  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  82.17 
 
 
470 aa  785  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346916  normal  0.136469 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5543  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  80.89 
 
 
470 aa  728  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3753  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.84 
 
 
471 aa  702  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.423097  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5779  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  81.1 
 
 
470 aa  740  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496694  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2120  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  63.48 
 
 
467 aa  601  1e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228007  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1850  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.41 
 
 
462 aa  588  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.513378  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1942  pyridine nucleotide transhydrogenase  63.4 
 
 
464 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.530716  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2295  pyridine nucleotide transhydrogenase  63.4 
 
 
464 aa  590  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1831  pyridine nucleotide transhydrogenase  63.4 
 
 
464 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1788  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.04 
 
 
462 aa  586  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2028  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.04 
 
 
462 aa  586  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2312  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.04 
 
 
462 aa  586  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1861  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.33 
 
 
462 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.885026 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1694  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.54 
 
 
462 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00431675  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1580  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.54 
 
 
462 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.339018  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1648  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.54 
 
 
462 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250723  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1589  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.54 
 
 
462 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.984324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1676  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.04 
 
 
462 aa  586  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.544393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1809  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.04 
 
 
462 aa  586  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.391181  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01571  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.04 
 
 
462 aa  586  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1597  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.12 
 
 
462 aa  585  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.240547  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01561  hypothetical protein  64.04 
 
 
462 aa  586  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2041  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  64.04 
 
 
462 aa  586  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181904  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4666  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  65.25 
 
 
465 aa  583  1e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1397  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  63.77 
 
 
481 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3741  pyridine nucleotide transhydrogenase  62.34 
 
 
469 aa  574  1e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000127  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  61.62 
 
 
458 aa  572  1e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129759  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0890  pyridine nucleotide transhydrogenase  59.44 
 
 
494 aa  572  1e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0967297  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3082  pyridine nucleotide transhydrogenase  59.44 
 
 
494 aa  572  1e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.167406  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0951  pyridine nucleotide transhydrogenase  60.64 
 
 
494 aa  572  1e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0853  pyridine nucleotide transhydrogenase  59.44 
 
 
494 aa  572  1e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0942  pyridine nucleotide transhydrogenase  60.64 
 
 
494 aa  572  1e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3066  pyridine nucleotide transhydrogenase  60.04 
 
 
494 aa  574  1e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00270245  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0917  pyridine nucleotide transhydrogenase  60.64 
 
 
494 aa  572  1e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05734  pyridine nucleotide transhydrogenase  60.97 
 
 
464 aa  570  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2841  pyridine nucleotide transhydrogenase  58.65 
 
 
494 aa  568  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3418  pyridine nucleotide transhydrogenase  60.44 
 
 
494 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0624  pyridine nucleotide transhydrogenase  61.94 
 
 
458 aa  569  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0498  pyridine nucleotide transhydrogenase  62.55 
 
 
458 aa  569  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.66801e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2079  pyridine nucleotide transhydrogenase  63.79 
 
 
457 aa  566  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153868  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0930  pyridine nucleotide transhydrogenase  60.4 
 
 
494 aa  565  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.339922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2584  pyridine nucleotide transhydrogenase  62.08 
 
 
464 aa  567  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2830  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.88 
 
 
466 aa  564  1e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2107  pyridine nucleotide transhydrogenase  62.26 
 
 
462 aa  564  1e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2400  pyridine nucleotide transhydrogenase  61.7 
 
 
462 aa  560  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228606  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1784  pyridine nucleotide transhydrogenase  62.31 
 
 
469 aa  558  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3195  pyridine nucleotide transhydrogenase  58.42 
 
 
494 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0565  pyridine nucleotide transhydrogenase  61.1 
 
 
458 aa  557  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1757  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.63 
 
 
466 aa  556  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284684  normal  0.879821 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0233  pyridine nucleotide transhydrogenase  58.67 
 
 
486 aa  552  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.448923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07830  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  60.17 
 
 
472 aa  550  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.368 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1862  pyridine nucleotide transhydrogenase  62.69 
 
 
462 aa  547  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.534712  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0904  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  61.68 
 
 
463 aa  538  1e-152  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278692  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2278  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.43 
 
 
466 aa  539  1e-152  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.314392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0192  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.87 
 
 
473 aa  535  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.57 
 
 
468 aa  531  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.04177  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4047  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  60.29 
 
 
479 aa  531  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.754185  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2266  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.7 
 
 
462 aa  532  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.366293 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3899  NAD(P)+ transhydrogenase beta chain  56.88 
 
 
477 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0665157  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1581  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.94 
 
 
482 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1882  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.74 
 
 
482 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2245  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.76 
 
 
468 aa  523  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0239  pyridine nucleotide transhydrogenase beta subunit  58.74 
 
 
482 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.993412  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0707  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.49 
 
 
477 aa  523  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.769172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2784  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.24 
 
 
472 aa  519  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2491  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.47 
 
 
480 aa  518  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0548  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.4 
 
 
482 aa  517  1e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1815  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  56.96 
 
 
492 aa  514  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380425  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1234  NAD(P)(+) transhydrogenase  55.53 
 
 
498 aa  506  1e-142  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.035089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  57.32 
 
 
471 aa  504  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3281  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  55.27 
 
 
502 aa  500  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1077  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  56.1 
 
 
480 aa  495  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1723  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  56.54 
 
 
491 aa  492  1e-138  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0109  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.03 
 
 
479 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0090  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.03 
 
 
479 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.190826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0100  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.03 
 
 
479 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0727  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.68 
 
 
479 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6856  pyridine nucleotide transhydrogenase (proton pump), beta subunit  53.89 
 
 
465 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0119  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.56 
 
 
479 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2181  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  54.41 
 
 
464 aa  471  1e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24220  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  55.37 
 
 
475 aa  467  1e-130  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5722  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  51.33 
 
 
489 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0277  pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta  52.47 
 
 
478 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4660  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  52.95 
 
 
467 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226968  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6364  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  51.55 
 
 
488 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275177  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5290  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  51.55 
 
 
488 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02470  pyridine nucleotide transhydrogenase, beta subunit  52.67 
 
 
478 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2804  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  53.88 
 
 
465 aa  463  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982075  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3366  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  53.36 
 
 
464 aa  461  1e-128  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5464  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  52.04 
 
 
484 aa  459  1e-128  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4006  putative NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  51.22 
 
 
484 aa  458  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161511  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5018  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  51.43 
 
 
484 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1845  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  52.25 
 
 
470 aa  456  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0749679  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0634  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  53.15 
 
 
470 aa  454  1e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.282238  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5072  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  52.18 
 
 
476 aa  452  1e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  hitchhiker  0.00886969 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2541  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.73 
 
 
483 aa  454  1e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0112  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  51.03 
 
 
477 aa  452  1e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>