More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1544 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 109 aa  220  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  83.16 
 
 		 98 aa  166  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  77.89 
 
 		 109 aa  155  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  69.9 
 
 		 106 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  71.58 
 
 		 111 aa  144  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  70.53 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  70.53 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  66.02 
 
 		 109 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  61.46 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 92 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 97 aa  98.2  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2026  transcriptional regulator, ArsR family  48.28 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1691  transcriptional regulator, ArsR family  48.28 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  40.38 
 
 		 102 aa  84.3  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  44.83 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  32.73 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  41.75 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  44.83 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  44.83 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  36.47 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  45 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  33.63 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  37.78 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  40.74 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  37.97 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  40.48 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  34 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  41.38 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  41.57 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  37.23 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  46.75 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  38.38 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  36.63 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  39.02 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  39.02 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  39.13 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  35.63 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  44.3 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.76 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  39.29 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  37.76 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  38.82 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1742  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11027 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  39.08 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  38.14 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  39.08 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>