52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1514 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1514  transcriptional regulator, PaaX family  100 
 
 		 316 aa  619  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139923  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0386  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  63.9 
 
 		 352 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000187716  normal  0.0170462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3103  PaaX family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000661945  decreased coverage  0.0000397547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3286  PaaX family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 307 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.17765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2610  PaaX family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218497  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2473  PaaX family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.303711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1521  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  42.61 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2623  PaaX family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0196  transcriptional regulator, PaaX family  41.12 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3734  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  40.4 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2859  transcriptional regulator, PaaX family  34.67 
 
 		 285 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0216  PaaX family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0165647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2864  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein paaX  41.97 
 
 		 293 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00499823  normal  0.0484276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7200  transcriptional regulator, PaaX family  39.17 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803046  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3083  PaaX family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.415086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1585  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  35.62 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2246  transcriptional regulator, PaaX family  35.62 
 
 		 316 aa  169  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2256  PaaX family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1486  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  35.62 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0692  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  37.07 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0895  PaaX family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 305 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0661  PaaX domain-containing protein, C- domain  28.67 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0708  PaaX family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 272 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719013  normal  0.640912 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2835  transcriptional regulator, PaaX family  26.18 
 
 		 285 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0655  PaaX family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0748596  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4812  PaaX domain-containing protein  33.45 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.33483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3357  transcriptional regulator, PaaX family  31.86 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0980  transcriptional regulator, PaaX family  33.07 
 
 		 259 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0094  PaaX family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4146  PaaX family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2009  transcriptional regulator, PaaX family  30.68 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2629  PaaX family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.495501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0787  transcriptional regulator, PaaX family  33.74 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2150  transcriptional regulator, PaaX family  30.8 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933136  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8420  putative transcriptional regulator, PaaX family  29.6 
 
 		 260 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0703  transcriptional regulator, PaaX family  29.3 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1206  PaaX domain-containing protein, C- domain  31.3 
 
 		 258 aa  96.3  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0294  transcriptional regulator, PaaX family  31.6 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0429653  hitchhiker  0.0000864342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6455  transcriptional regulator, PaaX family  30.28 
 
 		 260 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1609  PaaX family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1685  PaaX family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0710641  normal  0.260669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19070  phenylacetic acid-responsive transcriptional repressor  28.35 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0202563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0309  transcriptional regulator, PaaX family  29.1 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4899  transcriptional regulator, PaaX family  30.47 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0588  transcriptional regulator, PaaX family  28.29 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0436  PaaX-like  25.81 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.581976 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3828  PaaX family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0289  transcriptional regulator, PaaX family  26.99 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.010887  hitchhiker  0.0000784974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2025  transcriptional regulator, PaaX family  27.24 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5523  transcriptional regulator, PaaX family  28.96 
 
 		 267 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3784  putative transcriptional regulator, PaaX family  29 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1271  PaaX domain-containing protein, C- domain  29.96 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>