67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1477 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1095  Carbohydrate-selective porin OprB  70.28 
 
 		 464 aa  672    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0806614  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1477  Carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 462 aa  934    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4102  Carbohydrate-selective porin OprB  30.54 
 
 		 522 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.792226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0812  carbohydrate-selective porin OprB  29.97 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2156  carbohydrate-selective porin OprB  22.22 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4205  carbohydrate-selective porin OprB  22.64 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1057  carbohydrate-selective porin OprB  22.64 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1019  porin B  22.64 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3558  carbohydrate-selective porin OprB  24.63 
 
 		 534 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1017  carbohydrate-selective porin OprB  22.29 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.134295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4759  carbohydrate-selective porin OprB  24.79 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.15964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4576  carbohydrate-selective porin OprB  22.85 
 
 		 453 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3629  carbohydrate-selective porin OprB  23.94 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419401  decreased coverage  0.00176786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0852  carbohydrate-selective porin OprB  24.95 
 
 		 495 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34960  glucose-sensitive porin  31.33 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000209451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23030  glucose/carbohydrate outer membrane porin OprB precursor  31.33 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0211738 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4236  carbohydrate-selective porin OprB  24.2 
 
 		 492 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.269576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2950  glucose-sensitive porin  30.67 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.393124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1943  outer membrane porin OprB precursor  30.67 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5422  carbohydrate-selective porin OprB  24.12 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585602  normal  0.389505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3503  carbohydrate-selective porin OprB  24.12 
 
 		 514 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4863  carbohydrate-selective porin OprB  24.12 
 
 		 514 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0267  carbohydrate porin  24.09 
 
 		 514 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3023  carbohydrate porin  23.98 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3354  carbohydrate porin  23.98 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2894  Carbohydrate-selective porin OprB  22.09 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0489  carbohydrate porin  23.98 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2070  carbohydrate porin  23.98 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2652  carbohydrate porin  23.98 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.486905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0296  carbohydrate porin  23.98 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0904  Carbohydrate-selective porin OprB  28.48 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0673705 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1117  carbohydrate-selective porin OprB  28.17 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00415727  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1296  porin B  26.67 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329329  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0309  carbohydrate porin  23.77 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2957  carbohydrate-selective porin OprB  29.8 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4737  Carbohydrate-selective porin OprB  21.64 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0100904  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2351  carbohydrate-selective porin OprB  29.33 
 
 		 422 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.348926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1762  Carbohydrate-selective porin OprB  27.08 
 
 		 446 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2771  carbohydrate-selective porin OprB  21.43 
 
 		 534 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2969  carbohydrate-selective porin OprB  26.39 
 
 		 480 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1384  carbohydrate-selective porin OprB  25 
 
 		 490 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2204  carbohydrate-selective porin OprB  28.67 
 
 		 422 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3570  carbohydrate-selective porin OprB  28.67 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2998  Carbohydrate-selective porin OprB  21.51 
 
 		 534 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4276  carbohydrate-selective porin OprB  29.33 
 
 		 444 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.308576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1445  porin B  29.33 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.374886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1082  carbohydrate-selective porin OprB  29.33 
 
 		 448 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0774059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4360  carbohydrate-selective porin OprB  29.87 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.081551  normal  0.195321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4227  carbohydrate-selective porin OprB  22.65 
 
 		 498 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796044  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1659  Carbohydrate-selective porin OprB  24.36 
 
 		 490 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1331  carbohydrate-selective porin OprB  33.08 
 
 		 510 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901069  hitchhiker  0.00588319 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00490  regulator of pathogenicity factors  30 
 
 		 425 aa  50.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4366  carbohydrate-selective porin OprB  25.33 
 
 		 448 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00370105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1832  carbohydrate porin  27.1 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.378247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1735  carbohydrate-selective porin OprB  28.28 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0819299 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3953  carbohydrate-selective porin OprB  23.04 
 
 		 488 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268403  normal  0.112791 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4004  carbohydrate-selective porin OprB  27.27 
 
 		 483 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4200  Carbohydrate-selective porin OprB  22.17 
 
 		 482 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4831  Carbohydrate-selective porin OprB  26.35 
 
 		 507 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0156749  normal  0.100608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0997  hypothetical protein  27.54 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2711  carbohydrate-selective porin OprB  27.89 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.695739  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10870  hypothetical protein  29.32 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00009778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1380  Carbohydrate-selective porin OprB  22.15 
 
 		 522 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.768391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2150  Carbohydrate-selective porin OprB  23.45 
 
 		 418 aa  44.3  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000322479  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2522  carbohydrate-selective porin, OprB family  23.45 
 
 		 418 aa  44.3  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0118751  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0870  carbohydrate-selective porin OprB  26 
 
 		 481 aa  44.3  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  hitchhiker  0.00100235 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2860  carbohydrate-selective porin OprB  21.33 
 
 		 454 aa  43.1  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00385913  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>