More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1422 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  100 
 
 
499 aa  991    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  52.27 
 
 
526 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.94 
 
 
531 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  51.47 
 
 
513 aa  435  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  48.63 
 
 
501 aa  428  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.21 
 
 
487 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.77 
 
 
524 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.17 
 
 
519 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  50.9 
 
 
517 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.59 
 
 
515 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.15 
 
 
517 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  50.21 
 
 
517 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.77 
 
 
515 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  50.21 
 
 
523 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
517 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.11 
 
 
481 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
517 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  50 
 
 
518 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  50.43 
 
 
505 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  50.22 
 
 
505 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  50.97 
 
 
817 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  50.22 
 
 
505 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  50.22 
 
 
505 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  49.06 
 
 
517 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.35 
 
 
515 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.78 
 
 
484 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.37 
 
 
515 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  48.16 
 
 
515 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  50.43 
 
 
481 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.43 
 
 
493 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  51.32 
 
 
481 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  49.79 
 
 
500 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  48.88 
 
 
509 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.56 
 
 
482 aa  385  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.77 
 
 
485 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  45.86 
 
 
518 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  42.86 
 
 
506 aa  286  7e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  41.77 
 
 
496 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  37.72 
 
 
462 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  38.55 
 
 
463 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  39.08 
 
 
469 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
471 aa  273  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.9 
 
 
478 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  38.7 
 
 
480 aa  264  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1365  histidine kinase  36.9 
 
 
463 aa  263  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  37.61 
 
 
472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2579  histidine kinase  36.58 
 
 
466 aa  252  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1765  sensor histidine kinase  37.22 
 
 
466 aa  251  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  36.52 
 
 
474 aa  251  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  36.41 
 
 
475 aa  250  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
452 aa  249  6e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 
476 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 
480 aa  243  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  35.54 
 
 
439 aa  243  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54500  two-component sensor  39.07 
 
 
460 aa  243  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.452392 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  35.36 
 
 
471 aa  240  4e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2766  histidine kinase  38.67 
 
 
476 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989044  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
459 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  35.36 
 
 
472 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  35.93 
 
 
467 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  37.53 
 
 
460 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  35.09 
 
 
471 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
461 aa  236  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.9 
 
 
458 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.9 
 
 
458 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  37.3 
 
 
460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1879  sensor histidine kinase  37.41 
 
 
467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  36.05 
 
 
474 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
474 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
474 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
463 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
472 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
477 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
463 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 
461 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  35.03 
 
 
483 aa  230  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  42.41 
 
 
459 aa  229  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  42.41 
 
 
459 aa  229  9e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  42.41 
 
 
459 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  42.41 
 
 
459 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  42.41 
 
 
459 aa  229  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 
465 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
456 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  34.81 
 
 
504 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
457 aa  227  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  36.38 
 
 
500 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  42.41 
 
 
1093 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  34.69 
 
 
478 aa  226  6e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  34.69 
 
 
478 aa  226  6e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  35.73 
 
 
471 aa  226  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  34.89 
 
 
495 aa  226  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  42.27 
 
 
455 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  35.97 
 
 
501 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
501 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  35.97 
 
 
501 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 
455 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  35.97 
 
 
501 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 
455 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>