More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1421 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  72.27 
 
 
223 aa  317  9e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  69.6 
 
 
266 aa  314  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  70 
 
 
260 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  70.35 
 
 
247 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  69.91 
 
 
247 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  70.35 
 
 
250 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  70.35 
 
 
247 aa  310  9e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  70.35 
 
 
247 aa  310  9e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  70.35 
 
 
247 aa  310  9e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  69.55 
 
 
253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  68.42 
 
 
229 aa  306  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  70 
 
 
291 aa  305  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  69.09 
 
 
252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  68.42 
 
 
229 aa  304  8.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  68.95 
 
 
282 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  68.95 
 
 
282 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  68.64 
 
 
242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  68.64 
 
 
242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  68.64 
 
 
242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  68.64 
 
 
273 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  70.14 
 
 
224 aa  299  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.37 
 
 
236 aa  298  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.37 
 
 
235 aa  298  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  70.14 
 
 
223 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  70.14 
 
 
224 aa  294  7e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  69.68 
 
 
224 aa  293  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.23 
 
 
224 aa  292  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  69.23 
 
 
224 aa  291  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.33 
 
 
223 aa  291  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  67.87 
 
 
224 aa  288  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  67.87 
 
 
226 aa  286  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  65.91 
 
 
223 aa  286  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  65.45 
 
 
223 aa  285  5.999999999999999e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0550  response regulator transcription regulator protein  67.83 
 
 
232 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.837595  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.56 
 
 
224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  55.71 
 
 
224 aa  235  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  55.71 
 
 
224 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  55.71 
 
 
224 aa  234  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  55.71 
 
 
224 aa  234  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  55.71 
 
 
224 aa  234  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  55.25 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  54.79 
 
 
226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  54.79 
 
 
252 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  54.79 
 
 
252 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  54.79 
 
 
252 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  54.79 
 
 
252 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  54.79 
 
 
223 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  54.87 
 
 
230 aa  231  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  54.79 
 
 
287 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  54.84 
 
 
222 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  57.01 
 
 
224 aa  226  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1190  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.95 
 
 
227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  56.88 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  54.87 
 
 
226 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  53.6 
 
 
223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.96 
 
 
220 aa  215  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.97 
 
 
221 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  51.54 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  54.34 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  53.1 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  54.34 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  52.44 
 
 
223 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  52.91 
 
 
223 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 
231 aa  211  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  51.38 
 
 
218 aa  211  9e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  52.7 
 
 
223 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1045  two component transcriptional regulator  54.79 
 
 
223 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0254823  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  52.7 
 
 
221 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  52.7 
 
 
221 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  51.77 
 
 
223 aa  208  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 
225 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3389  two component transcriptional regulator  53.28 
 
 
234 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  51.77 
 
 
223 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 
225 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3281  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
226 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 
239 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3603  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
226 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  51.77 
 
 
223 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3535  two component transcriptional regulator  52.84 
 
 
234 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  57.8 
 
 
220 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  57.8 
 
 
220 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  57.8 
 
 
220 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  57.8 
 
 
220 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  57.8 
 
 
220 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3169  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 
266 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.121131 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  51.33 
 
 
223 aa  204  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 
223 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 
223 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  55.05 
 
 
220 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  57.87 
 
 
241 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  47.73 
 
 
226 aa  201  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  49.09 
 
 
223 aa  201  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  56.42 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3437  two component transcriptional regulator  51.32 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6140  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 
221 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0752147  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  57.41 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4078  DNA-binding response regulator  50 
 
 
230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0729773  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  57.34 
 
 
224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3339  DNA-binding response regulator  50 
 
 
230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>