More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1319 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  100 
 
 
179 aa  342  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  62.59 
 
 
179 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  54.19 
 
 
185 aa  186  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  62.59 
 
 
179 aa  184  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  57.05 
 
 
184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  54.19 
 
 
187 aa  175  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  55.26 
 
 
176 aa  167  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  55.13 
 
 
169 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  43.93 
 
 
178 aa  158  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  46.41 
 
 
164 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  55.19 
 
 
171 aa  155  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  46.1 
 
 
163 aa  153  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  50.32 
 
 
169 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  45.96 
 
 
164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  47.97 
 
 
164 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  47.95 
 
 
162 aa  150  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  45.16 
 
 
169 aa  147  7e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  43.14 
 
 
157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  49.04 
 
 
185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  49.66 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  47.89 
 
 
164 aa  144  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  48.98 
 
 
194 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  49.66 
 
 
194 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  49.67 
 
 
179 aa  143  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  44.44 
 
 
164 aa  143  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  45.83 
 
 
169 aa  142  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  43.79 
 
 
164 aa  140  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  46.31 
 
 
178 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  50.98 
 
 
183 aa  138  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  48.34 
 
 
173 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  44.52 
 
 
167 aa  136  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  40 
 
 
171 aa  136  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  44.23 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  45.14 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  42.14 
 
 
185 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  43.31 
 
 
167 aa  129  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  40.65 
 
 
164 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  44.76 
 
 
161 aa  129  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  42.14 
 
 
185 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  48.06 
 
 
191 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  48.06 
 
 
191 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  41.61 
 
 
181 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  48.78 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  38.31 
 
 
165 aa  123  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  45.21 
 
 
175 aa  120  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  35.88 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  35.88 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  35.88 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  35.88 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  44.3 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  35.88 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  35.88 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  36.31 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  36.31 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  35.88 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  44.97 
 
 
212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  37.13 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  36.54 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  41.03 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  43.62 
 
 
194 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  38.31 
 
 
160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  38.41 
 
 
165 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  38.41 
 
 
165 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  35.85 
 
 
178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  42.21 
 
 
194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  42.21 
 
 
194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  36.77 
 
 
171 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  36.31 
 
 
178 aa  117  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  32.53 
 
 
166 aa  117  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  36.77 
 
 
171 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  36.77 
 
 
171 aa  117  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  36.14 
 
 
175 aa  117  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  37.25 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  36.13 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  34.57 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  36.54 
 
 
164 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  33.96 
 
 
187 aa  114  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  35.95 
 
 
183 aa  114  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  32.12 
 
 
165 aa  114  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  34.62 
 
 
218 aa  114  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  35.33 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  32.52 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  32.52 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  37.59 
 
 
183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  33.33 
 
 
164 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  38.27 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  39.72 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  30.3 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  31.76 
 
 
169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  31.21 
 
 
165 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  37.5 
 
 
167 aa  111  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.10603 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  32.28 
 
 
167 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  32.28 
 
 
167 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  32.28 
 
 
167 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  32.28 
 
 
167 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  32.28 
 
 
167 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  32.28 
 
 
167 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  32.28 
 
 
167 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  32.28 
 
 
167 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  30.06 
 
 
165 aa  110  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>