More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1288 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1288  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1047  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  73.73 
 
 		 247 aa  361  6e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1091  CRP/FNR family transcriptional regulator  59.84 
 
 		 247 aa  315  6e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.140321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1163  CRP/FNR family transcriptional regulator  63.75 
 
 		 251 aa  314  7e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1007  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  61.97 
 
 		 242 aa  314  8e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2772  Crp/FNR family transcriptional regulator  64.66 
 
 		 245 aa  314  9e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2471  transcription factor Fnr  67.23 
 
 		 269 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.0435693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2782  Crp/FNR family transcriptional regulator  62.93 
 
 		 262 aa  311  7.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680307  normal  0.414614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1530  Crp/FNR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 239 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3775  CRP/FNR family transcriptional regulator  60 
 
 		 265 aa  307  8e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1207  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.72 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1937  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.91 
 
 		 223 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1111  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.9 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700786  normal  0.531022 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0792  CRP/FNR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 262 aa  268  8e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1204  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.46 
 
 		 242 aa  268  8e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1170  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.81 
 
 		 274 aa  267  8.999999999999999e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.01 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3345  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.797997  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1283  putative fumarate and nitrate reduction regulatory transcription regulator protein  54.55 
 
 		 242 aa  262  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0516193  normal  0.32826 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2037  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.16 
 
 		 232 aa  262  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441781 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0164  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1016  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2747  Crp/Fnr family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225266  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2604  Crp/Fnr family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5811  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 266 aa  260  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0190  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4294  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.81 
 
 		 272 aa  259  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1334  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1138  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.61 
 
 		 260 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2034  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  54.26 
 
 		 232 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.13 
 
 		 403 aa  258  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4486  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.16 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1554  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 259 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0129  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 259 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4280  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 257 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0900166 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1636  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 259 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3812  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 257 aa  255  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279241  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3138  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 248 aa  254  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1244  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 261 aa  254  8e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0606  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.91 
 
 		 267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149995 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4265  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.88 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367581  normal  0.892156 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5122  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.71 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5737  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.71 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.52 
 
 		 256 aa  252  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588975 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6195  Crp/FNR family transcriptional regulator  52 
 
 		 257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107166  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5008  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.71 
 
 		 249 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0212  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.68 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0460  CRP/FNR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 256 aa  249  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5904  Crp/FNR family transcriptional regulator  52 
 
 		 257 aa  249  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379633  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3149  Crp/FNR family transcriptional regulator  55 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4433  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 224 aa  248  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1540  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.91 
 
 		 630 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18142  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0031  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.91 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.91 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284481  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.91 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0051  cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases  52.91 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1464  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.91 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855917  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1184  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.91 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5297  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.09 
 
 		 248 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0035  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4272  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  53.24 
 
 		 218 aa  244  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71016  normal  0.563993 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4355  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.57 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4012  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.57 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5999  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.57 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.582695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1147  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  54.72 
 
 		 261 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1217  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  54.72 
 
 		 261 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1665  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.57 
 
 		 259 aa  241  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00239618  normal  0.130389 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3764  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.12 
 
 		 259 aa  238  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4238  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 257 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0460631  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1666  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.78 
 
 		 250 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0506299  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4561  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.48 
 
 		 263 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.291712 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4428  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.48 
 
 		 263 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0190  transcription regulator protein  49.12 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1692  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.816346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4521  Crp/Fnr family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0161618  normal  0.0108643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1811  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.66 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0319  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 262 aa  215  5e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44490  transcriptional regulator Anr  45.13 
 
 		 244 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3788  transcriptional regulator Anr  45.13 
 
 		 244 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4265  transcriptional regulator Anr  46.3 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1603  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3830  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525453 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1993  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.35 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.238952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3583  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3034  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 269 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.369454  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2471  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185946  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1991  transcriptional activator Anr  44.19 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3425  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  44.44 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2510  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.61 
 
 		 274 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.6173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.13 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0665535  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2018  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.56 
 
 		 252 aa  208  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2219  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.42 
 
 		 249 aa  208  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1703  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.35 
 
 		 276 aa  208  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0806739  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0931  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.6 
 
 		 249 aa  208  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.896198 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2417  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.41 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0646393  decreased coverage  0.000000159166 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1843  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.15 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177159  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1853  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.04 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.755428 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1450  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.59 
 
 		 250 aa  205  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>