152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1118 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
484 aa  946  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  42.19 
 
 
520 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  30.25 
 
 
502 aa  149  9e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  24.86 
 
 
510 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  4.90639e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  24.19 
 
 
492 aa  126  8e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  24.19 
 
 
492 aa  126  8e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  24.19 
 
 
492 aa  126  8e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  24.86 
 
 
510 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 
492 aa  126  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.61996e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  24.86 
 
 
503 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  24.86 
 
 
510 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  24.86 
 
 
510 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  24.19 
 
 
492 aa  126  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  24.19 
 
 
492 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  23.94 
 
 
492 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  24.94 
 
 
492 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  23.94 
 
 
492 aa  124  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 
507 aa  122  1e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 
507 aa  122  2e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 
479 aa  122  2e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 
484 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  27.56 
 
 
510 aa  120  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 
487 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  27.56 
 
 
510 aa  119  9e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  28.21 
 
 
483 aa  118  2e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  29.7 
 
 
508 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 
476 aa  116  1e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.39542e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  25.47 
 
 
490 aa  115  2e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 
480 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  26.4 
 
 
493 aa  114  4e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  25.73 
 
 
497 aa  113  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 
486 aa  112  1e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 
487 aa  112  1e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  25.4 
 
 
488 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 
509 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  28.09 
 
 
512 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  30.4 
 
 
503 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  28.76 
 
 
504 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  28.18 
 
 
448 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 
483 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  28.76 
 
 
504 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 
482 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  23.65 
 
 
483 aa  107  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 
509 aa  107  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 
487 aa  106  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 
503 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
499 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 
490 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.5001e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  31.42 
 
 
490 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 
489 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  26.14 
 
 
501 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 
499 aa  101  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 
501 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  23.68 
 
 
479 aa  99.4  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 
497 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 
533 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 
514 aa  98.2  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  25.4 
 
 
501 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  23.63 
 
 
482 aa  96.7  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 
491 aa  95.5  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 
484 aa  93.6  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 
475 aa  93.2  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 
575 aa  92.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  27.79 
 
 
504 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  23.49 
 
 
492 aa  91.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3528  polysaccharide biosynthesis protein  28.13 
 
 
481 aa  90.5  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000418203  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  27.45 
 
 
487 aa  90.9  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 
494 aa  90.5  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 
477 aa  90.5  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  1.36517e-07 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 
488 aa  90.1  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 
469 aa  90.1  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 
492 aa  90.1  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  27.83 
 
 
502 aa  89.7  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3847  PST family polysaccharide export protein  28.44 
 
 
437 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 
508 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 
500 aa  87.4  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  23.63 
 
 
500 aa  87  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 
504 aa  86.7  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
483 aa  86.7  1e-15  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  22.2 
 
 
505 aa  86.3  1e-15  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  28.02 
 
 
503 aa  85.1  2e-15  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 
483 aa  85.5  2e-15  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 
472 aa  85.5  2e-15  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  26.41 
 
 
500 aa  84.7  3e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 
502 aa  84.7  4e-15  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 
504 aa  84  5e-15  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 
500 aa  82.8  1e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 
507 aa  82  2e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  27.61 
 
 
498 aa  82.4  2e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 
514 aa  82  2e-14  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0832  polysaccharide biosynthesis protein  28.34 
 
 
432 aa  81.6  3e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  26.77 
 
 
467 aa  80.9  5e-14  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 
500 aa  80.1  7e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  20.43 
 
 
474 aa  79.7  1e-13  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 
498 aa  79.7  1e-13  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  20.43 
 
 
475 aa  79.7  1e-13  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  24.41 
 
 
497 aa  78.6  2e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 
490 aa  77.8  4e-13  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.41 
 
 
508 aa  77  7e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0429  polysaccharide biosynthesis protein  25.16 
 
 
497 aa  77  7e-13  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>