More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1069 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  100 
 
 		 372 aa  746    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  38.29 
 
 		 370 aa  156  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  34.47 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  34.76 
 
 		 358 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  31.57 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  33.16 
 
 		 352 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  30.73 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  33.82 
 
 		 401 aa  133  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  32.33 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  31.89 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  31.22 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  33.07 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  33.82 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  33.16 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  31.79 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  31.79 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  34.41 
 
 		 384 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  33 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  30.79 
 
 		 360 aa  122  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  35.07 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  31.4 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  31.97 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  34.38 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  31.95 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  29.19 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  28.87 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  33.25 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  29.02 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  32.61 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  30.88 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  30.05 
 
 		 352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  29.69 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  29.62 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  28.71 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  29.28 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  32.37 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  31.08 
 
 		 388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  31.18 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  33.22 
 
 		 363 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  29.5 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  31.9 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  35.76 
 
 		 368 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  32.44 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3122  periplasmic-binding protein  33.16 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00833115  normal  0.0608186 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  32.44 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  32.78 
 
 		 449 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  32.44 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  32.44 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  30.1 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  32.44 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  30.65 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  29.02 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  31.22 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  30.32 
 
 		 421 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  30.32 
 
 		 421 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  29.7 
 
 		 358 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2607  OmpC family outer membrane porin  31.29 
 
 		 363 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.782547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  29.79 
 
 		 397 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  32.03 
 
 		 392 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  32.03 
 
 		 392 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  30.23 
 
 		 387 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  29.66 
 
 		 372 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  30.2 
 
 		 367 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  29.21 
 
 		 368 aa  106  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  31.43 
 
 		 344 aa  105  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  31.6 
 
 		 387 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  28.99 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  30 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  37.79 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  29.47 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  31.91 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  30.29 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1352  porin  33.43 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  27.45 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  29.86 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  28.03 
 
 		 357 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  31.04 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  31.17 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  30.13 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  30.72 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  30 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  28.3 
 
 		 359 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  41.3 
 
 		 383 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  28 
 
 		 364 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  40.76 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  31.56 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  30.42 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3680  porin  29.56 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218397  normal  0.0162344 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  29.9 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  29.26 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  32.53 
 
 		 381 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  29.72 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  29.79 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  29.72 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  29.67 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  30.12 
 
 		 381 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  31 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  29.72 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  29.92 
 
 		 445 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  31 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>