More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0986 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 
495 aa  987    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  73.74 
 
 
496 aa  735    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  72.88 
 
 
496 aa  712    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  80.16 
 
 
499 aa  805    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  72.78 
 
 
475 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  69.11 
 
 
496 aa  660    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  79.92 
 
 
499 aa  810    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  70.91 
 
 
503 aa  722    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  51.89 
 
 
504 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  45.32 
 
 
493 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2017  transcriptional regulator  41.91 
 
 
505 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.70352  normal  0.217844 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  42.89 
 
 
496 aa  326  7e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
509 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
506 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
506 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
506 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
506 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
506 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
506 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.85 
 
 
515 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4362  GntR family transcriptional regulator  66.53 
 
 
271 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592404  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  37.65 
 
 
511 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
513 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
507 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.95 
 
 
497 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
475 aa  304  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.99 
 
 
494 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
507 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  37.01 
 
 
507 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
507 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  37.05 
 
 
503 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  35.51 
 
 
521 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
502 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
502 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  37.11 
 
 
502 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  37.08 
 
 
502 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
501 aa  299  6e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  37.03 
 
 
503 aa  299  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
502 aa  299  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  35.86 
 
 
501 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
501 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.31 
 
 
497 aa  297  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  35.66 
 
 
523 aa  296  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.82 
 
 
495 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
492 aa  294  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  35.65 
 
 
485 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  37.01 
 
 
507 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
507 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 
477 aa  291  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 
485 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
492 aa  290  6e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
501 aa  289  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.27 
 
 
501 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
485 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
495 aa  288  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  36.73 
 
 
520 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
490 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 
569 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.23 
 
 
485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
475 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  37.45 
 
 
476 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 
546 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 
564 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 
564 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  35.18 
 
 
561 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  36.85 
 
 
509 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
492 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.39 
 
 
503 aa  281  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.85 
 
 
504 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.88 
 
 
501 aa  279  8e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.43 
 
 
507 aa  279  9e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  37.55 
 
 
488 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
487 aa  277  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2189  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
499 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199182  hitchhiker  0.00899301 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.01 
 
 
485 aa  277  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  39.38 
 
 
501 aa  276  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 
492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  36 
 
 
509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.27 
 
 
500 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  36.53 
 
 
520 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
509 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  34.25 
 
 
509 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  35.18 
 
 
564 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 
564 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  37.73 
 
 
516 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.38 
 
 
485 aa  273  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  38.35 
 
 
502 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
494 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
509 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
516 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  38.74 
 
 
501 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 
502 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 
502 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
470 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  35.02 
 
 
495 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 
490 aa  269  7e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  36.17 
 
 
489 aa  269  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  36.42 
 
 
488 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
488 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
488 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>