More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0984 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 271 aa  550  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  81.32 
 
 		 270 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  80.93 
 
 		 280 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3709  alanine racemase domain-containing protein  82.61 
 
 		 283 aa  384  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.948517  normal  0.0157517 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4113  hypothetical protein  79.28 
 
 		 286 aa  377  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  67.62 
 
 		 261 aa  341  7e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  67.22 
 
 		 261 aa  338  4e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  68.57 
 
 		 257 aa  335  5.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  64.11 
 
 		 269 aa  324  8.000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  68.16 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  62.71 
 
 		 271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  62.71 
 
 		 262 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  60.76 
 
 		 276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  60.17 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  47.64 
 
 		 246 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  40.57 
 
 		 275 aa  212  3.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  44.35 
 
 		 241 aa  211  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  48.48 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  42.92 
 
 		 243 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  50.67 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  49.17 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  44.1 
 
 		 227 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  43.23 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  43.91 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  45.69 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  39.74 
 
 		 235 aa  175  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  45.42 
 
 		 248 aa  175  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  47.6 
 
 		 232 aa  175  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  46.29 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  48.05 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  45.31 
 
 		 244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  44.69 
 
 		 229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  44.44 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  42.67 
 
 		 229 aa  172  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  38.79 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  38.6 
 
 		 234 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  44.44 
 
 		 230 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  38.03 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  45.02 
 
 		 229 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  44.64 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  43.56 
 
 		 230 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  44.64 
 
 		 230 aa  165  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  37 
 
 		 230 aa  165  9e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  40.27 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  32.33 
 
 		 235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  45.19 
 
 		 228 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  35.08 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  40.89 
 
 		 226 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  42.67 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  35.45 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  44.71 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  48.47 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  38.5 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  36.56 
 
 		 224 aa  162  7e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  44.44 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  41.56 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  44.77 
 
 		 227 aa  161  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  44.84 
 
 		 234 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  43.68 
 
 		 272 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  44.74 
 
 		 237 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  41.56 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  44.02 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  44.35 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  45.85 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  42.22 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  45.85 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0930  alanine racemase domain protein  46.46 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246462  normal  0.758463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  45.78 
 
 		 229 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  40.26 
 
 		 237 aa  159  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  42.22 
 
 		 237 aa  158  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  41.6 
 
 		 241 aa  158  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  43.93 
 
 		 223 aa  158  9e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  48.28 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  41.38 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  43.75 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  47.26 
 
 		 238 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4225  alanine racemase domain protein  44.76 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0670129  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  41.1 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2378  alanine racemase domain protein  44.07 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  42.73 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  49.57 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  44.44 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  40.79 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  42.06 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  43.56 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  40.98 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  43.98 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  42.41 
 
 		 228 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  42.22 
 
 		 228 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  39.91 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3702  alanine racemase domain protein  50 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  43.3 
 
 		 228 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  49.78 
 
 		 232 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  42.98 
 
 		 237 aa  155  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  42.26 
 
 		 234 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  42.26 
 
 		 234 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  42.26 
 
 		 234 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  42.26 
 
 		 234 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  42.26 
 
 		 234 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>