More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0888 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  100 
 
 
273 aa  542  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  72.24 
 
 
270 aa  387  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  73.23 
 
 
270 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  67.3 
 
 
270 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  65.31 
 
 
282 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  66.28 
 
 
283 aa  362  4e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  66.04 
 
 
273 aa  361  8e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  68.22 
 
 
277 aa  360  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  68.22 
 
 
277 aa  360  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  62.41 
 
 
283 aa  357  9e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2962  ABC transporter ATP-binding protein  65.06 
 
 
279 aa  354  9e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  67.69 
 
 
273 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  67.86 
 
 
306 aa  352  3e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  67.05 
 
 
273 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  67.05 
 
 
273 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  67.05 
 
 
273 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  67.05 
 
 
273 aa  352  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  66.28 
 
 
273 aa  351  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  1.99293e-05 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  67.32 
 
 
272 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  67.05 
 
 
273 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  67.05 
 
 
273 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  67.84 
 
 
273 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  65.52 
 
 
286 aa  347  8e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  65.52 
 
 
286 aa  347  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  68 
 
 
272 aa  347  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  63.6 
 
 
286 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  67.46 
 
 
273 aa  346  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  67.6 
 
 
272 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  67.6 
 
 
272 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  67.6 
 
 
272 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  67.6 
 
 
272 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  67.6 
 
 
272 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  67.6 
 
 
272 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  66.14 
 
 
268 aa  342  3e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  65.65 
 
 
278 aa  341  7e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  60.92 
 
 
271 aa  333  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  65 
 
 
309 aa  334  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  63.67 
 
 
282 aa  332  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  60.85 
 
 
293 aa  331  7e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  65.75 
 
 
279 aa  331  8e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  63.57 
 
 
294 aa  327  1e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  3.12244e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1190  ATP-binding ABC transporter protein  61.57 
 
 
281 aa  321  9e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726252  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  56.82 
 
 
265 aa  318  4e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  57.31 
 
 
264 aa  316  2e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  56.44 
 
 
265 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  57.14 
 
 
269 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  61.6 
 
 
276 aa  316  3e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  59.2 
 
 
270 aa  316  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.14 
 
 
269 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  60.47 
 
 
270 aa  315  4e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  59.16 
 
 
275 aa  315  7e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2220  ABC transporter related  62.02 
 
 
283 aa  313  2e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  59.2 
 
 
269 aa  312  3e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  59.2 
 
 
269 aa  312  3e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  59.36 
 
 
267 aa  312  4e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  58.8 
 
 
269 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  58.08 
 
 
269 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  58.08 
 
 
269 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  58.8 
 
 
269 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  60.8 
 
 
261 aa  309  3e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  59.68 
 
 
277 aa  309  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  58.8 
 
 
269 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  56.92 
 
 
266 aa  308  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  59.16 
 
 
277 aa  309  4e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.08 
 
 
270 aa  307  1e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  59.92 
 
 
274 aa  303  1e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  57.09 
 
 
269 aa  303  1e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.92 
 
 
276 aa  303  2e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3304  ABC transporter-related protein  57.74 
 
 
292 aa  302  4e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  57.31 
 
 
265 aa  301  7e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3609  ABC transporter related  59.09 
 
 
270 aa  300  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2102  ABC transporter, ATP-binding protein  58.08 
 
 
267 aa  296  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2120  ABC transporter related  58.94 
 
 
274 aa  296  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03658  hypothetical protein  58.14 
 
 
267 aa  296  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0721  ABC transporter related  56.82 
 
 
272 aa  296  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0678  ABC transporter related  56.98 
 
 
272 aa  295  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0646516 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0679  ABC transporter related  56.82 
 
 
272 aa  295  6e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.962432 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0496  ABC transporter related  58.66 
 
 
273 aa  294  9e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00107814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3662  ABC transporter related  56.06 
 
 
279 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392823  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3343  ABC transporter related  56.82 
 
 
272 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002409  ABC transporter ATP-binding protein  57.75 
 
 
267 aa  294  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0722  ABC transporter related  56.06 
 
 
277 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.165434 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0692  ABC transporter related  56.06 
 
 
277 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0713  ABC transporter related  56.06 
 
 
272 aa  292  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3370  ABC transporter related  56.13 
 
 
274 aa  292  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3954  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.2 
 
 
272 aa  291  5e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0281  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  59.16 
 
 
270 aa  291  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0288  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  58.4 
 
 
270 aa  288  6e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03186  putative transport protein (ABC superfamily, atp-binding)  60.16 
 
 
266 aa  287  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4233  ABC transporter related  56.44 
 
 
271 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36582  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0561  ABC transporter related  55.77 
 
 
265 aa  286  3e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0505  toluene tolerance protein Ttg2A  56.87 
 
 
268 aa  284  1e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0733  ABC transporter-related protein  54.17 
 
 
267 aa  283  3e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.329181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3505  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  58.57 
 
 
270 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3574  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  58.57 
 
 
270 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3610  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  58.57 
 
 
270 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3503  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  58.57 
 
 
270 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260785  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3672  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  58.57 
 
 
270 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0355723 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3808  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  55.89 
 
 
269 aa  276  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4517  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  58.17 
 
 
269 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257918  normal  0.710569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>