More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0762 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  73.26 
 
 
476 aa  757    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  72.42 
 
 
476 aa  749    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  72.42 
 
 
476 aa  748    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  100 
 
 
476 aa  981    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  72.42 
 
 
476 aa  751    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  60.76 
 
 
477 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  54.45 
 
 
477 aa  541  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  54.83 
 
 
485 aa  541  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  36.83 
 
 
484 aa  313  3.9999999999999997e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  30.42 
 
 
470 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 
460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 
457 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 
450 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  25.55 
 
 
450 aa  182  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  30.6 
 
 
473 aa  180  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  28.41 
 
 
460 aa  177  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  30.48 
 
 
452 aa  177  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  27.1 
 
 
461 aa  177  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  27.8 
 
 
453 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  30.9 
 
 
462 aa  173  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  30.53 
 
 
465 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  32.13 
 
 
458 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  27.09 
 
 
447 aa  172  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  32.15 
 
 
456 aa  170  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 
450 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 
489 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  26.48 
 
 
452 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 
489 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  28.54 
 
 
463 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 
476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 
447 aa  138  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 
453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  28.35 
 
 
492 aa  133  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  26.1 
 
 
403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 
430 aa  117  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 
464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  23.87 
 
 
518 aa  109  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  37.34 
 
 
464 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  29.08 
 
 
486 aa  107  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  27.7 
 
 
457 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 
728 aa  105  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 
462 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  28.96 
 
 
436 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  24.12 
 
 
468 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 
470 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 
484 aa  90.5  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  27.07 
 
 
481 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  23.31 
 
 
481 aa  89.7  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 
440 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  27.35 
 
 
370 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 
474 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  26.65 
 
 
434 aa  87  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  26.56 
 
 
432 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  24.94 
 
 
507 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 
800 aa  84.3  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  26.02 
 
 
473 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  26.89 
 
 
397 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  27.52 
 
 
367 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 
499 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  27.79 
 
 
434 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  31.05 
 
 
433 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  24.8 
 
 
487 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  26.59 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  29.45 
 
 
431 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  29.45 
 
 
431 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  23.29 
 
 
431 aa  77  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  29.45 
 
 
447 aa  77  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  31.84 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  22.67 
 
 
455 aa  76.6  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  25.78 
 
 
275 aa  76.3  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  31.84 
 
 
398 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  23.88 
 
 
471 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  31.84 
 
 
398 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  28.77 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  22.97 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  30.72 
 
 
442 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  31.34 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  28.77 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0572  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 
353 aa  75.9  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  30.72 
 
 
442 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  30.48 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  31.34 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  23.96 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  25.77 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0156  radical SAM domain-containing protein  31.89 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  35.05 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.486348 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  23.96 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  23.96 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  23.96 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  36.72 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.821975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>