More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0672 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0672  uracil-xanthine permease  100 
 
 
415 aa  801    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0481  uracil-xanthine permease  68.8 
 
 
425 aa  559  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0464  uracil-xanthine permease  68.3 
 
 
425 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.774472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0932  uracil permease  66.5 
 
 
416 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.87035  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1077  uracil-xanthine permease  64.2 
 
 
425 aa  525  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1749  uracil permease  62.72 
 
 
417 aa  496  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002783  uracil permease  60.96 
 
 
417 aa  488  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4318  uracil permease  59.55 
 
 
441 aa  482  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03198  hypothetical protein  59.7 
 
 
417 aa  480  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2388  uracil permease  61.07 
 
 
416 aa  476  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1749  uracil-xanthine permease  59.6 
 
 
409 aa  472  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000246667  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1629  uracil-xanthine permease  58.85 
 
 
427 aa  472  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0348661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61480  uracil permease  60.25 
 
 
427 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.202144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5296  uracil permease  60.25 
 
 
427 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4298  uracil-xanthine permease  59.45 
 
 
411 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0402809 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1449  uracil-xanthine permease  56.65 
 
 
414 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0745  uracil-xanthine permease  59.26 
 
 
421 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4444  uracil-xanthine permease  59.26 
 
 
421 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.586178  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0773  uracil-xanthine permease  59.26 
 
 
421 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0786  uracil-xanthine permease  59.01 
 
 
424 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1649  uracil-xanthine permease  61.11 
 
 
412 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00322133  hitchhiker  0.000377571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4729  xanthine/uracil permease  59.51 
 
 
424 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.667812  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1574  uracil-xanthine permease  61.11 
 
 
412 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000671953  normal  0.0882987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1641  uracil-xanthine permease  60.86 
 
 
412 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000740931  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2879  uracil permease  60.35 
 
 
412 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1821  uracil-xanthine permease  60.61 
 
 
416 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000647194  normal  0.178091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0968  xanthine/uracil permease family protein  58.02 
 
 
425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2162  uracil-xanthine permease  60.91 
 
 
415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1980  uracil-xanthine permease  56.16 
 
 
418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472534  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1836  uracil-xanthine permease  61.21 
 
 
411 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0253304  normal  0.750298 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1641  uracil-xanthine permease  60.1 
 
 
407 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000923826  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1784  uracil-xanthine permease  60.1 
 
 
416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000126712  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2501  uracil-xanthine permease  60.35 
 
 
416 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000161239  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1777  uracil-xanthine permease  60.1 
 
 
416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000163317  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1689  uracil-xanthine permease  60.1 
 
 
412 aa  450  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000578916  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1967  uracil-xanthine permease  55.09 
 
 
419 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.522211  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1918  uracil-xanthine permease  61.99 
 
 
409 aa  451  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00881195  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1965  uracil-xanthine permease  58.94 
 
 
418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2443  uracil-xanthine permease  59.75 
 
 
408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.161391  normal  0.0740726 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0945  uracil-xanthine permease  59 
 
 
420 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0996  uracil-xanthine permease  54.75 
 
 
411 aa  428  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.594707  hitchhiker  0.00519474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1129  uracil transporter  57 
 
 
406 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0766553  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1342  uracil permease  55.96 
 
 
413 aa  431  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00369344  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0997  uracil-xanthine permease  54.37 
 
 
419 aa  425  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0593  uracil permease (Uracil transporter)  54.25 
 
 
412 aa  423  1e-117  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0341896  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2248  uracil-xanthine permease  54 
 
 
421 aa  420  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00954559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2088  uracil-xanthine permease  55.28 
 
 
412 aa  418  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0212  uracil permease  52.15 
 
 
417 aa  409  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0419  permease subfamily protein  52.5 
 
 
411 aa  410  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1126  uracil permease  51.13 
 
 
395 aa  393  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.930887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  47.68 
 
 
409 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  45.11 
 
 
430 aa  332  6e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  44.86 
 
 
427 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  44.86 
 
 
427 aa  331  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  44.61 
 
 
427 aa  329  4e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  44.61 
 
 
427 aa  330  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  44.61 
 
 
438 aa  329  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  44.61 
 
 
427 aa  329  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  44.61 
 
 
427 aa  329  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  41.59 
 
 
415 aa  329  5.0000000000000004e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  44.61 
 
 
438 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  44.61 
 
 
438 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0066  uracil-xanthine permease  41.9 
 
 
403 aa  324  2e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00626483  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  44.11 
 
 
427 aa  323  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0765  uracil permease  44.91 
 
 
430 aa  320  3e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0108  uracil-xanthine permease  44.36 
 
 
399 aa  319  6e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0107  uracil-xanthine permease  44.36 
 
 
399 aa  319  6e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.681241  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  44.55 
 
 
435 aa  319  6e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  44.55 
 
 
435 aa  319  6e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1089  uracil-xanthine permease  44.2 
 
 
430 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355646  hitchhiker  0.00900914 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  40.81 
 
 
423 aa  300  3e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0606  uracil-xanthine permease  41.58 
 
 
403 aa  299  6e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000016937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1043  uracil-xanthine permease  44.44 
 
 
434 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000103466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1913  uracil-xanthine permease  45.98 
 
 
432 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0460  uracil-xanthine permease  41.16 
 
 
423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000162343  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  42.54 
 
 
433 aa  282  9e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1422  uracil-xanthine permease  39.12 
 
 
436 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0087754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  38.55 
 
 
457 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1232  uracil permease  39.12 
 
 
436 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.011581  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  40.76 
 
 
432 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  40.76 
 
 
432 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  40.52 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  38.52 
 
 
422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0056  uracil-xanthine permease  42 
 
 
434 aa  272  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21167 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1876  xanthine/uracil permease  41.75 
 
 
423 aa  271  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.355169  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1891  uracil-xanthine permease  43.77 
 
 
394 aa  269  8e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0490  xanthine/uracil permease  41.35 
 
 
443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0186546  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0910  uracil-xanthine permease  37.14 
 
 
428 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00327811 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  36.92 
 
 
432 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  36.76 
 
 
432 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1711  xanthine/uracil permease  39.85 
 
 
430 aa  264  2e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10659  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  37.19 
 
 
429 aa  263  6e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0429  uracil-xanthine permease  39.52 
 
 
447 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000136785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  37.68 
 
 
429 aa  260  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06450  uracil-xanthine permease  37.86 
 
 
469 aa  257  3e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.285171  normal  0.461399 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  36.45 
 
 
428 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  36.45 
 
 
428 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  36.7 
 
 
429 aa  255  8e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1115  uracil-xanthine permease  36.69 
 
 
433 aa  255  9e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  36.45 
 
 
429 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>