More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0631 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  100 
 
 
599 aa  1186    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  53.89 
 
 
596 aa  601  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  41.37 
 
 
592 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  41.37 
 
 
592 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  42.05 
 
 
592 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  39.93 
 
 
592 aa  412  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  39.08 
 
 
592 aa  412  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  40.77 
 
 
593 aa  405  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  38.69 
 
 
592 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  38.69 
 
 
592 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  39.01 
 
 
598 aa  363  7.0000000000000005e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  34.05 
 
 
624 aa  361  2e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  37.33 
 
 
596 aa  349  7e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  39.41 
 
 
599 aa  347  3e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  33.33 
 
 
602 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  33.73 
 
 
596 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  34.63 
 
 
588 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  34.32 
 
 
597 aa  327  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  33.39 
 
 
588 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  32.39 
 
 
607 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  33.1 
 
 
596 aa  309  9e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  32.93 
 
 
596 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  33.71 
 
 
622 aa  300  4e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  34.97 
 
 
588 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  35.54 
 
 
589 aa  295  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  33.39 
 
 
589 aa  295  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  32.32 
 
 
591 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  33.04 
 
 
588 aa  291  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  36.74 
 
 
588 aa  289  9e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  33.94 
 
 
608 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  34.67 
 
 
581 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  34.97 
 
 
588 aa  280  5e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  32.31 
 
 
592 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  35.44 
 
 
618 aa  277  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  33.6 
 
 
616 aa  277  4e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  33.03 
 
 
609 aa  276  7e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  32.43 
 
 
623 aa  276  7e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  31.17 
 
 
609 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  32.62 
 
 
618 aa  272  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  30.57 
 
 
612 aa  271  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  34.78 
 
 
587 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  33 
 
 
592 aa  267  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  33.96 
 
 
588 aa  267  4e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  31.83 
 
 
614 aa  267  5e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  31.62 
 
 
613 aa  266  5.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  30.49 
 
 
605 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  30.52 
 
 
609 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  30.32 
 
 
605 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  31.79 
 
 
627 aa  263  6.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  33.06 
 
 
613 aa  263  6.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  31.35 
 
 
601 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  33.62 
 
 
591 aa  261  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  31.03 
 
 
605 aa  260  6e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  32.31 
 
 
605 aa  257  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  31.03 
 
 
593 aa  253  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  31.53 
 
 
634 aa  249  7e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  32.03 
 
 
591 aa  249  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  27.99 
 
 
588 aa  247  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  30.32 
 
 
590 aa  247  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3434  TrkA-C  31.54 
 
 
603 aa  246  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0196864  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  28.89 
 
 
588 aa  246  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  29.76 
 
 
610 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3584  TrkA-C domain protein  31.76 
 
 
609 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  29.15 
 
 
588 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  32.28 
 
 
606 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3516  TrkA-C domain protein  31.38 
 
 
609 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  27.14 
 
 
594 aa  239  9e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  27.46 
 
 
619 aa  239  9e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  32.57 
 
 
619 aa  239  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  28.98 
 
 
610 aa  238  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  28.98 
 
 
630 aa  238  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  28.98 
 
 
610 aa  237  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  30.23 
 
 
632 aa  237  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  30.95 
 
 
596 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  32.32 
 
 
583 aa  236  9e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  30.43 
 
 
610 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  31.13 
 
 
609 aa  236  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  30.34 
 
 
593 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  27.45 
 
 
593 aa  234  3e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  30.84 
 
 
594 aa  234  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  28.31 
 
 
602 aa  233  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  28.15 
 
 
611 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  28.57 
 
 
602 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  28.79 
 
 
602 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.43 
 
 
610 aa  229  8e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  30.43 
 
 
610 aa  229  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  30.43 
 
 
610 aa  229  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  30.43 
 
 
610 aa  229  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.43 
 
 
610 aa  229  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  30.43 
 
 
610 aa  229  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  29.06 
 
 
606 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  30.43 
 
 
610 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  28.14 
 
 
602 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  29.24 
 
 
641 aa  228  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  27.23 
 
 
590 aa  227  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  28.81 
 
 
610 aa  227  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  28.5 
 
 
616 aa  226  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  29.32 
 
 
610 aa  226  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  29.98 
 
 
619 aa  226  7e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  30.33 
 
 
609 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>