More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0584 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
291 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  81.51 
 
 
289 aa  498  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  72.73 
 
 
296 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  70.83 
 
 
287 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  70.03 
 
 
287 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  65.38 
 
 
282 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  64.79 
 
 
290 aa  394  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  64.69 
 
 
283 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  64.69 
 
 
283 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  64.69 
 
 
283 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  64.69 
 
 
283 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  65.03 
 
 
283 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  64.34 
 
 
283 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  63.64 
 
 
283 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  63.64 
 
 
283 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  63.64 
 
 
283 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  65.03 
 
 
283 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  61.97 
 
 
284 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  59.86 
 
 
288 aa  371  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  59.15 
 
 
282 aa  363  2e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  58.74 
 
 
285 aa  352  5e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  56.85 
 
 
291 aa  348  7e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  58.1 
 
 
283 aa  344  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  55.36 
 
 
292 aa  335  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3654  formyltetrahydrofolate deformylase  56.12 
 
 
290 aa  335  5.999999999999999e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  56.94 
 
 
286 aa  335  5.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  54.01 
 
 
284 aa  334  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  57.44 
 
 
316 aa  332  3e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  54.9 
 
 
284 aa  320  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4965  formyltetrahydrofolate deformylase  52.9 
 
 
289 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
297 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00467  formyltetrahydrofolate deformylase  53.87 
 
 
267 aa  305  7e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  52.13 
 
 
300 aa  298  7e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 
300 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 
283 aa  295  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  48.43 
 
 
290 aa  292  4e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  51.41 
 
 
282 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  51.41 
 
 
284 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  48.07 
 
 
284 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 
296 aa  287  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 
287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  48.07 
 
 
284 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  49.12 
 
 
287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  49.13 
 
 
281 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  48.63 
 
 
287 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  48.24 
 
 
303 aa  281  7.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  48.81 
 
 
294 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  48.96 
 
 
287 aa  280  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  48.12 
 
 
294 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  48.12 
 
 
294 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  48.76 
 
 
283 aa  280  3e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  48.98 
 
 
289 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
299 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  47.49 
 
 
294 aa  278  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  48.45 
 
 
287 aa  278  6e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  48.77 
 
 
282 aa  278  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  48.46 
 
 
294 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  48.46 
 
 
294 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  48.42 
 
 
282 aa  278  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  47.78 
 
 
294 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  48.42 
 
 
282 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  49.13 
 
 
289 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  48.25 
 
 
287 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  49.31 
 
 
288 aa  276  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 
283 aa  275  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 
294 aa  275  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  47.55 
 
 
287 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  49.12 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  49.12 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  48.96 
 
 
289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  47.06 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  47.37 
 
 
282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  48.59 
 
 
294 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  46.64 
 
 
284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  46.64 
 
 
284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  48.25 
 
 
285 aa  273  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
294 aa  273  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0643  formyltetrahydrofolate deformylase  48.25 
 
 
284 aa  273  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 
294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 
294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  50.7 
 
 
295 aa  272  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  47.55 
 
 
287 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
296 aa  272  5.000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2508  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 
288 aa  272  6e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  48.07 
 
 
291 aa  271  8.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  47.55 
 
 
283 aa  271  1e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  47.02 
 
 
282 aa  270  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  47.89 
 
 
294 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  48.07 
 
 
302 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  48.26 
 
 
288 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  47.55 
 
 
283 aa  270  2e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  44.52 
 
 
289 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  47.22 
 
 
287 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  48.6 
 
 
284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  48.07 
 
 
285 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  48.6 
 
 
282 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03765  formyltetrahydrofolate deformylase  51.44 
 
 
263 aa  269  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>