More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0575 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  100 
 
 
344 aa  686    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  58.51 
 
 
346 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  58.49 
 
 
362 aa  343  4e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  48.5 
 
 
370 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  48.5 
 
 
352 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  48.5 
 
 
352 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  48.35 
 
 
352 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2253  ApbE family protein  49.64 
 
 
291 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  43.15 
 
 
347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  40.8 
 
 
350 aa  227  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3926  ApbE family lipoprotein  44.62 
 
 
366 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166642  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3187  positive regulator of sigma E, RseC/MucC  43.17 
 
 
365 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.981913 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3188  ApbE family protein  42.9 
 
 
524 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  41.9 
 
 
351 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  39.68 
 
 
349 aa  195  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2402  ApbE family lipoprotein  37.05 
 
 
350 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0511  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 
360 aa  159  7e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  32.56 
 
 
380 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  30.4 
 
 
350 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  37.42 
 
 
331 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  36.2 
 
 
351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.12 
 
 
363 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  31.21 
 
 
353 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  33.12 
 
 
349 aa  144  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  37.07 
 
 
386 aa  143  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  34.54 
 
 
348 aa  142  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  35 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.39 
 
 
343 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  32.81 
 
 
349 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  30.03 
 
 
348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  37.54 
 
 
350 aa  140  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  34.24 
 
 
343 aa  139  6e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  31.89 
 
 
353 aa  138  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  36.16 
 
 
335 aa  136  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  29.67 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  33.44 
 
 
336 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  30.42 
 
 
343 aa  133  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  39.02 
 
 
308 aa  132  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.75 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  30 
 
 
360 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  30.09 
 
 
338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  34.56 
 
 
340 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  34.78 
 
 
306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  37.82 
 
 
327 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  32.2 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  36.93 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  33.95 
 
 
326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  39.23 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  35.06 
 
 
340 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  31.65 
 
 
338 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  28.94 
 
 
366 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  31.79 
 
 
338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  27.62 
 
 
342 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  30.72 
 
 
337 aa  126  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  30.14 
 
 
374 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  34.15 
 
 
336 aa  126  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  33.69 
 
 
359 aa  125  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  33.69 
 
 
345 aa  125  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  30.14 
 
 
347 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  34.6 
 
 
369 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  30.14 
 
 
374 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  30.91 
 
 
374 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  30.39 
 
 
348 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  28.93 
 
 
309 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  30.39 
 
 
348 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  30.39 
 
 
348 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  30.39 
 
 
348 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  28.79 
 
 
371 aa  124  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  34.58 
 
 
361 aa  124  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  35.05 
 
 
379 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  33.08 
 
 
322 aa  123  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.8 
 
 
306 aa  123  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  30.04 
 
 
336 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  26.74 
 
 
350 aa  123  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.61 
 
 
336 aa  122  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.21 
 
 
331 aa  122  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.39 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  26.65 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  32.75 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.06 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  30.7 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  35.58 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  34.96 
 
 
344 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.57 
 
 
313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0984  ApbE family lipoprotein  36.8 
 
 
323 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.174547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  38.26 
 
 
332 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  34.41 
 
 
368 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  35.46 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.82 
 
 
347 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  31.69 
 
 
379 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  31.91 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  29.91 
 
 
338 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  33.23 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  31.37 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  31.37 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  29.06 
 
 
381 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  35.83 
 
 
362 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.76 
 
 
367 aa  116  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  29.96 
 
 
312 aa  116  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>