108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0554 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  100 
 
 
423 aa  855    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  52.31 
 
 
389 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  23.21 
 
 
527 aa  93.2  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  32.56 
 
 
554 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  28.47 
 
 
552 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  27.96 
 
 
489 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  30.22 
 
 
527 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  26.8 
 
 
521 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  25.11 
 
 
523 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  32.74 
 
 
466 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  34.34 
 
 
1426 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  34.17 
 
 
1177 aa  71.2  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  31.71 
 
 
1209 aa  70.1  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  32.76 
 
 
1299 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  26.13 
 
 
524 aa  67  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  30.18 
 
 
629 aa  66.6  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  26.64 
 
 
595 aa  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  33.75 
 
 
1154 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  26.35 
 
 
553 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  21.9 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  25.76 
 
 
493 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  34.23 
 
 
950 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  36.44 
 
 
573 aa  62.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  31.21 
 
 
1693 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  23.74 
 
 
533 aa  61.2  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.24 
 
 
836 aa  61.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  32.43 
 
 
1036 aa  60.1  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  32.03 
 
 
1722 aa  60.1  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0961  N-6 DNA methylase  29.38 
 
 
677 aa  60.1  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  28 
 
 
604 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  29.6 
 
 
1257 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  30.97 
 
 
1194 aa  58.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  30.36 
 
 
1058 aa  58.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  29.76 
 
 
1703 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  32.2 
 
 
1338 aa  57.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  30.81 
 
 
478 aa  57.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  31.68 
 
 
495 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  39.78 
 
 
285 aa  57.4  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  28.79 
 
 
2117 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  34.26 
 
 
416 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  27.78 
 
 
974 aa  56.6  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  23.5 
 
 
410 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  31.82 
 
 
1700 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  29.6 
 
 
1244 aa  55.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  32.9 
 
 
1697 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  29.13 
 
 
1186 aa  55.5  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  28.57 
 
 
1256 aa  55.5  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
577 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  26.36 
 
 
1252 aa  54.3  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  25.33 
 
 
1159 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  30.43 
 
 
995 aa  54.3  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  31.82 
 
 
1417 aa  53.9  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  27.62 
 
 
1612 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  24.65 
 
 
1076 aa  52.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  28.76 
 
 
587 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  28.76 
 
 
579 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  19.74 
 
 
1104 aa  50.8  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  30.3 
 
 
1748 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  28.96 
 
 
2005 aa  50.8  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  24.06 
 
 
539 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.19 
 
 
1432 aa  50.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  29.55 
 
 
562 aa  50.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  26.05 
 
 
535 aa  50.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  29.26 
 
 
470 aa  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  30.69 
 
 
1701 aa  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  29.76 
 
 
578 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  29.76 
 
 
578 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  26.19 
 
 
694 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
1516 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  22.95 
 
 
1147 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  31.87 
 
 
584 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  31.39 
 
 
1594 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  30.3 
 
 
1702 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  24.62 
 
 
1125 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  27.69 
 
 
570 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  32.08 
 
 
557 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  33.06 
 
 
1925 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  21.43 
 
 
486 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  25.7 
 
 
540 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  22.73 
 
 
522 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  25.2 
 
 
1241 aa  47.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  25.22 
 
 
563 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  25.94 
 
 
534 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2939  N-6 DNA methylase  27.68 
 
 
926 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  20.91 
 
 
1132 aa  47  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0144  hypothetical protein  33.7 
 
 
261 aa  47  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  26.38 
 
 
1170 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4247  hypothetical protein  26.87 
 
 
509 aa  46.6  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102223  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  26.95 
 
 
1210 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  26.98 
 
 
1697 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2329  N-6 DNA methylase  26.34 
 
 
538 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  23.14 
 
 
504 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  29.1 
 
 
1497 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  25.3 
 
 
1219 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  27.13 
 
 
518 aa  45.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  23.08 
 
 
1144 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  26.72 
 
 
1231 aa  44.3  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5719  hypothetical protein  34.74 
 
 
205 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1409  N-6 DNA methylase  28.5 
 
 
698 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  23.81 
 
 
1218 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>