23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0553 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0553  Patatin  100 
 
 		 828 aa  1635    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25380  Patatin-like phospholipase  52.56 
 
 		 825 aa  828    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.969394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2089  patatin  53.17 
 
 		 830 aa  830    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0919743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0742  patatin  53.2 
 
 		 816 aa  843    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.885952  normal  0.0715613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1083  patatin  37.42 
 
 		 818 aa  479  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4091  patatin  35.51 
 
 		 774 aa  360  8e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0030  patatin  36.32 
 
 		 770 aa  346  1e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.491773  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2051  hypothetical protein  39.3 
 
 		 773 aa  259  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475949  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3407  patatin-related protein  27.24 
 
 		 818 aa  196  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2615  patatin  28.71 
 
 		 926 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0888746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1602  Patatin  27.85 
 
 		 1137 aa  159  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0045  Patatin  23.72 
 
 		 1107 aa  158  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.604758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1052  patatin  28.45 
 
 		 1171 aa  132  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3961  Patatin  23.41 
 
 		 1056 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5555  patatin  25.9 
 
 		 954 aa  75.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1147  patatin-related protein  28.51 
 
 		 818 aa  76.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0770474  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2668  hypothetical protein  26.25 
 
 		 978 aa  70.5  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7272  patatin  37.69 
 
 		 1101 aa  68.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.341762  normal  0.239541 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1675  patatin family phospholipase  25.97 
 
 		 1153 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160434  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2776  Patatin  27.82 
 
 		 1383 aa  52  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13514  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1031 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.577448 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5159  Patatin  25.12 
 
 		 1320 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51871  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0052  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1142 aa  45.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>