225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0519 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  100 
 
 
256 aa  515  1e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  53.75 
 
 
257 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  55.02 
 
 
254 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  54.51 
 
 
256 aa  274  1e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  54.51 
 
 
256 aa  273  2e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  52.99 
 
 
255 aa  271  6e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  54.8 
 
 
255 aa  270  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  54.15 
 
 
256 aa  268  6e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  56.86 
 
 
262 aa  268  6e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  57.94 
 
 
260 aa  264  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  53.36 
 
 
256 aa  262  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  53.01 
 
 
255 aa  258  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  53.39 
 
 
254 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  4.04715e-05 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  52.99 
 
 
254 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  53.39 
 
 
255 aa  255  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  53.44 
 
 
258 aa  255  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  53.6 
 
 
255 aa  254  1e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  50.4 
 
 
251 aa  253  2e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1386  LamB/YcsF family protein  53.41 
 
 
266 aa  253  2e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.624042 
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  51.6 
 
 
260 aa  253  2e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  49 
 
 
255 aa  251  9e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  55.92 
 
 
254 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1341  LamB/YcsF family protein  49 
 
 
255 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  51.39 
 
 
256 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  51.37 
 
 
258 aa  247  1e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  50.79 
 
 
257 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  46.83 
 
 
255 aa  244  8e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  46.83 
 
 
255 aa  244  8e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  46.43 
 
 
255 aa  244  1e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  49.2 
 
 
256 aa  244  1e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  51.98 
 
 
260 aa  242  4e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3352  LamB/YcsF family protein  52.61 
 
 
253 aa  241  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  51.19 
 
 
261 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  51.04 
 
 
255 aa  241  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 
274 aa  240  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 
254 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 
255 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  50.41 
 
 
252 aa  239  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  52.02 
 
 
251 aa  239  3e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  48.4 
 
 
257 aa  238  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  47.92 
 
 
255 aa  238  6e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  50.61 
 
 
254 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  48.57 
 
 
254 aa  236  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  51.19 
 
 
260 aa  235  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  51.59 
 
 
256 aa  235  5e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  50 
 
 
252 aa  234  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  49.41 
 
 
256 aa  234  8e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  50.79 
 
 
255 aa  234  1e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  50.39 
 
 
255 aa  233  2e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  54.18 
 
 
304 aa  232  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  45.75 
 
 
254 aa  231  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  52.21 
 
 
252 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  47.41 
 
 
254 aa  228  5e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  48.98 
 
 
245 aa  227  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  48.98 
 
 
245 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.36688e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  48.98 
 
 
245 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.33292e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 
257 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 
253 aa  226  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  44.44 
 
 
252 aa  226  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 
253 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  48.41 
 
 
253 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  48.37 
 
 
244 aa  226  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  46.59 
 
 
254 aa  225  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1216  LamB/YcsF family protein  48.78 
 
 
245 aa  225  5e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 
253 aa  224  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  44.94 
 
 
253 aa  224  8e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  51.43 
 
 
251 aa  224  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  43.53 
 
 
256 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  48.4 
 
 
254 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  48.4 
 
 
254 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  49.21 
 
 
254 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  48.4 
 
 
254 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1497  LamB/YcsF family protein  52.82 
 
 
251 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258316  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2923  LamB/YcsF family protein  47.56 
 
 
244 aa  221  6e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140615  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00673  hypothetical protein  47.56 
 
 
244 aa  221  8e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  42.74 
 
 
253 aa  221  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00662  hypothetical protein  47.56 
 
 
244 aa  221  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  47.56 
 
 
244 aa  221  8e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  49.59 
 
 
250 aa  221  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1829  LamB/YcsF family protein  48.76 
 
 
242 aa  221  8e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0738  LamB/YcsF family protein  47.15 
 
 
244 aa  221  1e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0761  LamB/YcsF family protein  47.15 
 
 
244 aa  221  1e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 
273 aa  221  1e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1257  LamB/YcsF family protein  48.78 
 
 
245 aa  221  1e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.187621  normal  0.809316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0803  LamB/YcsF family protein  47.15 
 
 
244 aa  220  2e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.179932  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  49.03 
 
 
258 aa  220  2e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0361  LamB/YcsF family protein  44.77 
 
 
256 aa  219  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.135278  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  43.32 
 
 
253 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 
253 aa  219  4e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0630  LamB/YcsF family protein  46.75 
 
 
244 aa  219  4e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  46.94 
 
 
246 aa  218  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  51.02 
 
 
249 aa  218  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  43.32 
 
 
253 aa  218  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  43.32 
 
 
253 aa  218  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1138  LamB/YcsF family protein  47.74 
 
 
245 aa  218  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1228  LamB/YcsF family protein  49.19 
 
 
245 aa  217  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  47.77 
 
 
253 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  43.55 
 
 
250 aa  215  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  46.67 
 
 
250 aa  215  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0871  LamB/YcsF family protein  48.35 
 
 
244 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  0.149027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>