More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0504 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0504  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 399 aa  785    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196433  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  70.86 
 
 		 400 aa  475  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  56.12 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.76 
 
 		 422 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.68 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.7 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  55.94 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  56.85 
 
 		 394 aa  378  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  53.72 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.73 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  52.58 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.2 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  56.91 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  59.15 
 
 		 395 aa  364  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  55.65 
 
 		 409 aa  361  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2967  multidrug resistance protein  57.64 
 
 		 415 aa  360  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  51.32 
 
 		 386 aa  358  8e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  53.39 
 
 		 382 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  53.39 
 
 		 382 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  53.66 
 
 		 382 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  55.62 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  53.62 
 
 		 382 aa  356  5e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.76 
 
 		 381 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  51.76 
 
 		 381 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  52.17 
 
 		 425 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.3 
 
 		 379 aa  355  1e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  52.29 
 
 		 381 aa  354  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  57.06 
 
 		 394 aa  354  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  51.83 
 
 		 395 aa  352  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  51.83 
 
 		 395 aa  352  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  51.49 
 
 		 381 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  51.83 
 
 		 388 aa  352  7e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  52.57 
 
 		 382 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  49.86 
 
 		 379 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  48.98 
 
 		 386 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  51.31 
 
 		 409 aa  344  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  49.2 
 
 		 385 aa  343  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  51.48 
 
 		 381 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  57.5 
 
 		 386 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000318769  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  51.05 
 
 		 397 aa  343  4e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.05 
 
 		 397 aa  343  4e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  51.05 
 
 		 397 aa  343  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  51.05 
 
 		 397 aa  343  4e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  51.05 
 
 		 397 aa  343  4e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  51.05 
 
 		 397 aa  343  4e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  51.05 
 
 		 409 aa  343  4e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  48.47 
 
 		 385 aa  343  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  52.42 
 
 		 420 aa  342  5e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.21 
 
 		 385 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  48.21 
 
 		 385 aa  341  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  50.37 
 
 		 426 aa  342  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  50.79 
 
 		 409 aa  341  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  48.21 
 
 		 385 aa  341  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  48.21 
 
 		 385 aa  341  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  52.49 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.64 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  47.96 
 
 		 385 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  49.61 
 
 		 428 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  52.17 
 
 		 424 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  52.17 
 
 		 424 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  52.17 
 
 		 424 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  51.06 
 
 		 412 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  47.96 
 
 		 385 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  47.96 
 
 		 385 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  53.09 
 
 		 418 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  50.51 
 
 		 383 aa  339  7e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  49.6 
 
 		 386 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  50.51 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.96 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  50.26 
 
 		 384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  52.17 
 
 		 420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  50.13 
 
 		 383 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  49.34 
 
 		 386 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4025  RND family efflux transporter MFP subunit  58.31 
 
 		 383 aa  335  7e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.259915 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  50.92 
 
 		 412 aa  335  7e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  51.9 
 
 		 420 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  51.9 
 
 		 420 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  51.9 
 
 		 420 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  51.9 
 
 		 420 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  51.9 
 
 		 420 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  51.9 
 
 		 420 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0103  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.21 
 
 		 382 aa  335  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2325  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.92 
 
 		 446 aa  334  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116121  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  51.29 
 
 		 384 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1335  RND family efflux transporter MFP subunit  55.47 
 
 		 385 aa  333  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.47 
 
 		 396 aa  334  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  52.54 
 
 		 412 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3719  RND family efflux transporter MFP subunit  52.23 
 
 		 353 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  53.06 
 
 		 412 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  49.34 
 
 		 405 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  51.58 
 
 		 431 aa  332  8e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  52.48 
 
 		 432 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2836  RND family efflux transporter MFP subunit  51.62 
 
 		 446 aa  332  9e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113713  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  50.53 
 
 		 382 aa  331  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.76 
 
 		 411 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  49.87 
 
 		 385 aa  331  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.22 
 
 		 410 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  50.14 
 
 		 385 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  50.14 
 
 		 385 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  50.74 
 
 		 390 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>