18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0496 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0496  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  226  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1418  hypothetical protein  55.65 
 
 
113 aa  130  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1728  hypothetical protein  54.78 
 
 
113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0613  hypothetical protein  56.03 
 
 
113 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1985  hypothetical protein  60.34 
 
 
114 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0551  hypothetical protein  54.78 
 
 
113 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.295838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2968  hypothetical protein  52.17 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0869  hypothetical protein  53.04 
 
 
115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7320  hypothetical protein  49.15 
 
 
115 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2046  hypothetical protein  40.34 
 
 
118 aa  92  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127106 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2219  hypothetical protein  38.18 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246381 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0486  hypothetical protein  46.15 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.407371  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1871  hypothetical protein  40.54 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.159127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0135  hypothetical protein  44.44 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1905  hypothetical protein  31.71 
 
 
134 aa  58.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0164  hypothetical protein  36 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0215  hypothetical protein  33.04 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250298  hitchhiker  0.0000000000000580905 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2968  hypothetical protein  35.06 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>