189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0453 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  100 
 
 
158 aa  315  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  62.82 
 
 
156 aa  198  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  60.87 
 
 
162 aa  196  1e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  59.63 
 
 
162 aa  194  5e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  58.43 
 
 
185 aa  180  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  58.64 
 
 
163 aa  179  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0952  LysM domain/BON superfamily protein  55.69 
 
 
167 aa  175  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954636  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  58.6 
 
 
158 aa  175  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.46101e-06  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  55.42 
 
 
166 aa  172  2e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  55.09 
 
 
195 aa  172  2e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  53.01 
 
 
166 aa  171  3e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  58.49 
 
 
156 aa  170  8e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  58.49 
 
 
156 aa  170  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  58.49 
 
 
156 aa  170  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1881  LysM domain/BON superfamily protein  58.49 
 
 
156 aa  170  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168616  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  58.28 
 
 
161 aa  168  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1904  LysM domain/BON superfamily protein  57.86 
 
 
156 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169778 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  58.28 
 
 
161 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1818  LysM domain/BON superfamily protein  58.49 
 
 
156 aa  167  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1790  LysM domain/BON superfamily protein  58.49 
 
 
156 aa  167  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  55.48 
 
 
145 aa  164  3e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  61.29 
 
 
153 aa  164  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  54.84 
 
 
145 aa  163  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  55.62 
 
 
160 aa  162  2e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2836  LysM domain/BON superfamily protein  52.26 
 
 
148 aa  154  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2167  LysM domain/BON superfamily protein  53.16 
 
 
156 aa  143  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.420767  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  49.07 
 
 
161 aa  142  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2304  LysM domain/BON superfamily protein  52.53 
 
 
156 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2264  LysM domain/BON superfamily protein  52.53 
 
 
156 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2427  LysM domain/BON superfamily protein  52.53 
 
 
156 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  44.58 
 
 
168 aa  140  8e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0258  LysM domain/BON superfamily protein  48.08 
 
 
146 aa  137  5e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0155386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0273  LysM domain/BON superfamily protein  48.08 
 
 
146 aa  137  5e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3097  LysM domain/BON superfamily protein  45.86 
 
 
149 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2975  LysM domain/BON superfamily protein  45.86 
 
 
149 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.870465  normal  0.0673181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2940  LysM domain/BON superfamily protein  45.86 
 
 
149 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2992  LysM domain/BON superfamily protein  45.86 
 
 
149 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.021376 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2908  LysM domain/BON superfamily protein  45.86 
 
 
149 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3216  LysM domain/BON superfamily protein  45.28 
 
 
149 aa  135  3e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2800  LysM domain/BON superfamily protein  45.28 
 
 
149 aa  135  3e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02485  hypothetical protein  45.28 
 
 
149 aa  135  3e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3907  LysM domain/BON superfamily protein  45.28 
 
 
149 aa  135  3e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.979345  normal  0.391605 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2945  LysM domain/BON superfamily protein  45.28 
 
 
149 aa  135  3e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  42.51 
 
 
168 aa  135  3e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  7.2506e-05  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02521  hypothetical protein  45.28 
 
 
149 aa  135  3e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  41.92 
 
 
168 aa  134  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1018  Peptidoglycan-binding LysM  45.28 
 
 
149 aa  134  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1041  LysM domain/BON superfamily protein  45.28 
 
 
149 aa  134  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0283  LysM domain/BON superfamily protein  46.15 
 
 
146 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  45.28 
 
 
149 aa  134  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.267708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4952  LysM domain/BON superfamily protein  46.15 
 
 
150 aa  134  7e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182933  hitchhiker  1.84292e-05 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0302  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  47.1 
 
 
155 aa  133  1e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  51.61 
 
 
154 aa  126  9e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  44.87 
 
 
146 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4943  LysM domain/BON superfamily protein  45.51 
 
 
146 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0282  LysM domain/BON superfamily protein  44.23 
 
 
146 aa  117  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3255  LysM domain/BON superfamily protein  44.31 
 
 
157 aa  114  4e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  43.59 
 
 
143 aa  110  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  54.9 
 
 
97 aa  72  3e-12  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  62 
 
 
219 aa  68.9  2e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 
1910 aa  62  3e-09  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1358  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 
230 aa  59.7  2e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.98649e-10  hitchhiker  5.9516e-20 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0285  peptidoglycan-binding LysM  45.1 
 
 
1095 aa  59.3  2e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2195  peptidoglycan-binding LysM  46.15 
 
 
238 aa  57.4  8e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.96131e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  43.64 
 
 
405 aa  56.6  1e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5282  Peptidoglycan-binding LysM  38.89 
 
 
552 aa  56.6  1e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.772795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4963  peptidoglycan-binding LysM  46.15 
 
 
380 aa  56.2  2e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867782  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5209  Peptidoglycan-binding LysM  38.89 
 
 
511 aa  56.2  2e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.263437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4742  peptidoglycan-binding LysM  38.89 
 
 
511 aa  56.2  2e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  48.21 
 
 
546 aa  55.8  2e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0461  peptidoglycan-binding LysM  47.06 
 
 
439 aa  55.8  2e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.520913  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0972  peptidoglycan-binding LysM  40.35 
 
 
546 aa  55.5  3e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1464  LysM domain-containing protein  46.15 
 
 
229 aa  55.1  3e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.026138  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 
651 aa  55.1  3e-07  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 
1079 aa  55.8  3e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 
428 aa  53.9  7e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2328  peptidoglycan-binding LysM  41.07 
 
 
234 aa  53.9  9e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  3.46433e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1636  Peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 
451 aa  53.5  1e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 
1051 aa  53.1  1e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4527  peptidoglycan-binding LysM  34.62 
 
 
123 aa  52.8  2e-06  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.292703  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1930  peptidoglycan-binding LysM  38.89 
 
 
503 aa  52.8  2e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0490055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  40.74 
 
 
242 aa  52.8  2e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0448  LysM domain-containing protein  42.55 
 
 
404 aa  52.4  2e-06  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0441  LysM domain-containing protein  42.55 
 
 
404 aa  52.4  2e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21565  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  51.02 
 
 
190 aa  53.1  2e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  46.15 
 
 
235 aa  52.4  3e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2902  Peptidoglycan-binding LysM  39.71 
 
 
230 aa  50.8  8e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.93442e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0939  peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 
309 aa  50.1  1e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.013426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 
572 aa  50.1  1e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1766  hypothetical protein  45.83 
 
 
531 aa  50.4  1e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.905557  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  30.84 
 
 
352 aa  50.4  1e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  38.71 
 
 
356 aa  49.3  2e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  48.98 
 
 
1091 aa  49.3  2e-05  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 
339 aa  49.3  2e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1323  Peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 
230 aa  49.7  2e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.6395e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2152  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 
334 aa  49.7  2e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  48.98 
 
 
256 aa  48.9  3e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  41.67 
 
 
390 aa  48.5  3e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1910  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 
382 aa  48.5  3e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 
395 aa  48.5  3e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>