97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0351 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0351  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  807    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0328547  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  25 
 
 
601 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  24.75 
 
 
615 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  24.01 
 
 
607 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  24.11 
 
 
619 aa  73.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  24.46 
 
 
612 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  25.13 
 
 
625 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  23.41 
 
 
616 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  22.19 
 
 
610 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  22.76 
 
 
607 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0356  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.59 
 
 
603 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  21.23 
 
 
619 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  24.28 
 
 
554 aa  60.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  24.51 
 
 
613 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  21.98 
 
 
593 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  22.69 
 
 
588 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  24.8 
 
 
768 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2691  hypothetical protein  27.91 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486273  normal  0.199519 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  23.45 
 
 
815 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  25.29 
 
 
634 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  23.98 
 
 
632 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  24.56 
 
 
616 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2668  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.41 
 
 
629 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  23.65 
 
 
617 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1567  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.39 
 
 
629 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  23.4 
 
 
593 aa  51.6  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  27.8 
 
 
703 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  27.8 
 
 
703 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  30.48 
 
 
550 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  25.19 
 
 
708 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  25.73 
 
 
662 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1058  hypothetical protein  22.43 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0139648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0349  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.55 
 
 
599 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3574  UvrD/REP helicase  30.21 
 
 
646 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  25.23 
 
 
690 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  37.29 
 
 
696 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  25.35 
 
 
737 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0474  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.96 
 
 
1469 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  24.79 
 
 
689 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1726  UvrD/REP helicase  22.4 
 
 
593 aa  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  24.79 
 
 
689 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  24.79 
 
 
689 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  24.64 
 
 
827 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  24.63 
 
 
673 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  37.35 
 
 
681 aa  47.8  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  25.99 
 
 
568 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5233  putative helicase superfamily I  25.28 
 
 
486 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161896  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1569  putative DNA helicase  25.28 
 
 
486 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3306  hypothetical protein  25.91 
 
 
662 aa  47  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000532342  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  25 
 
 
689 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  26.28 
 
 
706 aa  46.6  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  23.95 
 
 
777 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  24.29 
 
 
551 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  24.43 
 
 
689 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  24.28 
 
 
704 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  26.92 
 
 
702 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  24.38 
 
 
689 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  26.18 
 
 
697 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  24.38 
 
 
689 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  23.95 
 
 
776 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  25.84 
 
 
778 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2323  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.79 
 
 
505 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.488765 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_51012  protein required for proper timing of committment to meiotic recombination and the transition from Meiosis I to Meiosis II  32.95 
 
 
908 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.875639  normal  0.91244 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  24.28 
 
 
704 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4102  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.68 
 
 
761 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.28 
 
 
704 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3174  UvrD/REP helicase  23.01 
 
 
557 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.938492  unclonable  0.0000000000000324964 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  23.95 
 
 
776 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.35 
 
 
685 aa  45.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  42.37 
 
 
687 aa  44.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  25.73 
 
 
741 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  23.95 
 
 
777 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  24.17 
 
 
748 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0754  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.65 
 
 
587 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.643559  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000320  DNA helicase IV  25.19 
 
 
689 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  23.95 
 
 
776 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  24.62 
 
 
699 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  23.95 
 
 
776 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.23 
 
 
759 aa  44.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  26.23 
 
 
734 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  24.16 
 
 
615 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2306  putative DNA helicase  37.5 
 
 
499 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  25 
 
 
549 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  23.46 
 
 
705 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  23.57 
 
 
777 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.1 
 
 
686 aa  44.3  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  24.8 
 
 
691 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  24.28 
 
 
689 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  24.44 
 
 
679 aa  43.9  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1045  UvrD/REP helicase  35.05 
 
 
587 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52657  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0621  DNA helicase  24.15 
 
 
1715 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2003  DNA helicase  36.11 
 
 
499 aa  43.9  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5077  UvrD/REP helicase  34.12 
 
 
600 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935976  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  23.6 
 
 
946 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  23.27 
 
 
691 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  23.6 
 
 
946 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  30 
 
 
683 aa  42.7  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>