More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0166 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0166  ABC transporter related  100 
 
 
225 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0073  ABC transporter related  52.53 
 
 
223 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.606283 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0701  ABC transporter related  50.54 
 
 
197 aa  165  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3634  ABC transporter related  48.6 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0077  ABC transporter related  51.26 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0734436  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0129  ABC transporter related  45.95 
 
 
202 aa  162  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00335673  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0197  ABC transporter related protein  50.78 
 
 
206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.994247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3121  ABC transporter related  46.94 
 
 
207 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.522166  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0768  ABC transporter related  48.07 
 
 
199 aa  155  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2103  ABC transporter related  46.45 
 
 
213 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.71434  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0122  ABC transporter related protein  46.24 
 
 
205 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.60914  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2409  ABC transporter related  49.72 
 
 
201 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1836  ABC transporter, ATPase subunit  48.98 
 
 
209 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2240  ABC transporter related  48.66 
 
 
206 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.748351  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7996  ABC transporter related  49.2 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0883006  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  32.49 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  31.98 
 
 
220 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  31.98 
 
 
220 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  34.83 
 
 
225 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  34.83 
 
 
225 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.83 
 
 
225 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  34.86 
 
 
225 aa  105  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.86 
 
 
225 aa  105  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.86 
 
 
225 aa  105  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.86 
 
 
225 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.86 
 
 
225 aa  105  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 
225 aa  104  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  37.37 
 
 
264 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.29 
 
 
225 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.3 
 
 
225 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  37.24 
 
 
222 aa  101  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1375  ABC transporter related  35.64 
 
 
254 aa  101  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6306  ABC transporter related  39.7 
 
 
233 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1773  ABC transporter related  39.7 
 
 
233 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057555  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19480  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  40.29 
 
 
233 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.544408  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1798  ABC transporter related  39.2 
 
 
233 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  40.7 
 
 
231 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  31.94 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1068  ABC transporter, ATP-binding protein  40.7 
 
 
231 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1310  ABC transporter, ATP-binding protein  40.7 
 
 
231 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2267  ABC transporter, ATP-binding protein  39.7 
 
 
276 aa  99.4  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2152  ABC transporter, ATP-binding protein  40.7 
 
 
264 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0098  ABC transporter, ATP-binding protein  40.7 
 
 
231 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1797  ABC transporter, ATP-binding protein  40.7 
 
 
231 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2320  ABC transporter, ATP-binding protein  40.7 
 
 
276 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1684  ABC transporter related  39.2 
 
 
233 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5622  ABC transporter related protein  38.05 
 
 
239 aa  98.2  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.630537  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  37.25 
 
 
549 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.83 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.83 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  34.45 
 
 
250 aa  97.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  38.14 
 
 
516 aa  97.1  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.27 
 
 
225 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  34.6 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.27 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.27 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  34.83 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3014  ABC transporter component  32.31 
 
 
364 aa  95.9  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  32.99 
 
 
222 aa  96.3  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  32.47 
 
 
244 aa  95.5  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1712  ABC transporter related  38.69 
 
 
266 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  27.78 
 
 
240 aa  95.5  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
227 aa  95.5  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0550  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  34.09 
 
 
250 aa  95.1  8e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0373794  hitchhiker  0.0000103016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1084  ABC transporter related  39.42 
 
 
255 aa  94.7  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  39.15 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  35.38 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0681  ABC transporter related  37.16 
 
 
283 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1525  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  33.64 
 
 
250 aa  94.4  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.198861  normal  0.606343 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  35.68 
 
 
229 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  34.85 
 
 
249 aa  94  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0493  ABC transporter related  30.39 
 
 
259 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0612  ABC transporter related  36.17 
 
 
228 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037706  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  34.17 
 
 
247 aa  93.2  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  38.46 
 
 
365 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  31.09 
 
 
364 aa  93.2  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2322  ABC transporter, ATPase subunit  35.43 
 
 
242 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0967  ABC transporter related  40.72 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.205736  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  32.38 
 
 
237 aa  92.8  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  32.99 
 
 
350 aa  92.8  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5071  ABC transporter, ATPase subunit  37.69 
 
 
233 aa  92.8  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310601  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  37.75 
 
 
250 aa  92.4  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  29.38 
 
 
218 aa  92.4  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  35.44 
 
 
257 aa  92.4  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  32.67 
 
 
532 aa  92.4  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4980  ABC transporter, ATP-binding protein  32 
 
 
250 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  35.68 
 
 
373 aa  92.4  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2129  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  30.5 
 
 
240 aa  92  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4731  ABC transporter ATP-binding protein  31.5 
 
 
250 aa  92  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4571  ABC transporter, ATP-binding protein  31.5 
 
 
250 aa  92  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00946862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4591  ABC transporter, ATP-binding protein  31.5 
 
 
250 aa  92  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4952  ABC transporter, ATP-binding protein  31.5 
 
 
250 aa  92  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5091  ABC transporter ATP-binding protein  31.5 
 
 
250 aa  92  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2001  methionine transport ATP-binding protein  29.9 
 
 
351 aa  92  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.974934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0195  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  29.9 
 
 
351 aa  92  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  34.34 
 
 
249 aa  91.7  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  39.3 
 
 
363 aa  92  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1498  ABC transporter related  38.58 
 
 
233 aa  91.7  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0282182 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4330  ABC transporter related protein  38.89 
 
 
231 aa  91.7  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.19 
 
 
237 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>