More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0099 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  60.05 
 
 
992 aa  1025  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0229  DNA topoisomerase III  58.67 
 
 
876 aa  1000  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00108901 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  67.07 
 
 
869 aa  1122  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  66.47 
 
 
896 aa  1124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  62.06 
 
 
920 aa  1071  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2998  DNA topoisomerase III  48.58 
 
 
939 aa  775  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  0.170765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  70.76 
 
 
839 aa  1207  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  65.9 
 
 
846 aa  1120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  67.07 
 
 
869 aa  1123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  65.74 
 
 
865 aa  1140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  65.86 
 
 
865 aa  1138  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  65.86 
 
 
865 aa  1141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  67.03 
 
 
888 aa  1143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  58.74 
 
 
1002 aa  1009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  65.66 
 
 
876 aa  1116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  66.95 
 
 
891 aa  1124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  60.12 
 
 
980 aa  1026  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  61.55 
 
 
876 aa  1063  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0898  DNA topoisomerase III  47.15 
 
 
869 aa  749  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  100 
 
 
854 aa  1755  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  67.07 
 
 
869 aa  1123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  67.07 
 
 
906 aa  1123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  60.3 
 
 
981 aa  1016  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  66.79 
 
 
908 aa  1141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  65.66 
 
 
876 aa  1117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  66.06 
 
 
877 aa  1106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  65.86 
 
 
865 aa  1146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  67.39 
 
 
889 aa  1148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  59.91 
 
 
982 aa  1013  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  59.51 
 
 
975 aa  1012  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3177  DNA topoisomerase III  57.79 
 
 
920 aa  957  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.272894  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  59.42 
 
 
990 aa  1016  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  67.07 
 
 
869 aa  1123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  60.3 
 
 
981 aa  1023  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  60.44 
 
 
879 aa  1035  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  65.74 
 
 
891 aa  1106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  65.51 
 
 
865 aa  1142  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  67.07 
 
 
869 aa  1122  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  65.28 
 
 
865 aa  1140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  67.07 
 
 
869 aa  1123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  65.74 
 
 
865 aa  1140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0401  DNA topoisomerase  49.53 
 
 
851 aa  699  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0152197  decreased coverage  5.78583e-05 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0033  putative DNA topoisomerase III  41.18 
 
 
815 aa  586  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  39.03 
 
 
799 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  42.06 
 
 
754 aa  523  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  41.18 
 
 
701 aa  522  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  41.53 
 
 
695 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  37.3 
 
 
867 aa  502  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1814  DNA topoisomerase III  38.63 
 
 
746 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.9095e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  41.24 
 
 
721 aa  469  1e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0349  DNA topoisomerase  40.35 
 
 
689 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.26912  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  41.01 
 
 
686 aa  462  1e-128  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  39.81 
 
 
729 aa  446  1e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.76541e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  39.34 
 
 
729 aa  440  1e-122  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  39.76 
 
 
722 aa  442  1e-122  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  39.49 
 
 
729 aa  442  1e-122  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  39.19 
 
 
729 aa  439  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  39.04 
 
 
729 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  38.92 
 
 
729 aa  439  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  38.92 
 
 
729 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  39.19 
 
 
729 aa  439  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  39.19 
 
 
729 aa  439  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  38.92 
 
 
729 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  39.19 
 
 
729 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  39.19 
 
 
729 aa  439  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  39.35 
 
 
697 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3176  DNA topoisomerase III  39.17 
 
 
873 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  39.58 
 
 
620 aa  424  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3236  DNA topoisomerase  36.78 
 
 
777 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  34.4 
 
 
731 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  38.09 
 
 
731 aa  418  1e-115  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  38.27 
 
 
730 aa  399  1e-110  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  36.36 
 
 
675 aa  385  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.75285e-05 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  33.74 
 
 
718 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  32.23 
 
 
768 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1822  DNA topoisomerase type IA central domain protein  36.29 
 
 
573 aa  371  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2044  DNA topoisomerase type IA central domain protein  37.48 
 
 
608 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00726991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  35.02 
 
 
719 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1612  DNA topoisomerase III  34.55 
 
 
680 aa  368  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  34.45 
 
 
712 aa  365  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  34.5 
 
 
707 aa  361  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0003  DNA topoisomerase 3  30.76 
 
 
717 aa  354  4e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  9.70275e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  32.93 
 
 
714 aa  353  6e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0087  DNA topoisomerase III  31.03 
 
 
717 aa  353  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.451504 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1725  DNA topoisomerase III  33.33 
 
 
714 aa  353  9e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0147593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1911  DNA topoisomerase III  33.33 
 
 
714 aa  352  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1940  DNA topoisomerase III  33.2 
 
 
714 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08242e-41 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0839  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  33.2 
 
 
681 aa  353  1e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0618738  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1905  DNA topoisomerase III  33.2 
 
 
714 aa  352  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000492134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1767  DNA topoisomerase III  33.2 
 
 
714 aa  352  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.258845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1984  DNA topoisomerase III  33.06 
 
 
714 aa  352  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3433  DNA topoisomerase III  33.2 
 
 
714 aa  352  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.2124e-06  hitchhiker  4.99159e-09 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2011  DNA topoisomerase III  33.06 
 
 
714 aa  351  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00587828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1744  DNA topoisomerase III  33.2 
 
 
714 aa  351  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.129964  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1495  DNA topoisomerase III  34.16 
 
 
697 aa  350  8e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0210844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3021  DNA topoisomerase  32.66 
 
 
689 aa  350  8e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1472  DNA topoisomerase III  36.03 
 
 
714 aa  347  6e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  9.39771e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0022  DNA topoisomerase III  31.15 
 
 
718 aa  344  3e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270283  normal  0.995092 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1836  DNA topoisomerase III  33.94 
 
 
711 aa  339  1e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  8.86336e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0911  DNA topoisomerase  33.38 
 
 
741 aa  339  1e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>