More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0097 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 387 aa  742    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  55.84 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  52.65 
 
 		 336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  51.05 
 
 		 372 aa  348  1e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  55.58 
 
 		 401 aa  346  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  56.61 
 
 		 320 aa  345  6e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  52.44 
 
 		 408 aa  344  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  53.12 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  55.87 
 
 		 401 aa  338  9e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  55.18 
 
 		 402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3862  DNA processing protein DprA, putative  46.76 
 
 		 409 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 386 aa  333  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  50.88 
 
 		 386 aa  332  8e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  50.88 
 
 		 399 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  49.1 
 
 		 374 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  52.69 
 
 		 382 aa  316  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  48.82 
 
 		 388 aa  315  9e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  50.26 
 
 		 368 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  52.11 
 
 		 365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  52.11 
 
 		 365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  50 
 
 		 365 aa  311  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  49.52 
 
 		 421 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  49.33 
 
 		 389 aa  308  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  50.91 
 
 		 379 aa  305  8.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  49.87 
 
 		 399 aa  302  7.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  52.7 
 
 		 434 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  49.47 
 
 		 364 aa  300  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  52.44 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  51.82 
 
 		 379 aa  299  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  47.89 
 
 		 405 aa  299  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  48.56 
 
 		 448 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  48.04 
 
 		 375 aa  295  6e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  52.44 
 
 		 434 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  48.14 
 
 		 377 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  52.19 
 
 		 434 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  52.19 
 
 		 434 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  52.19 
 
 		 396 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  52.19 
 
 		 396 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  48.88 
 
 		 422 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  48.9 
 
 		 422 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  49.75 
 
 		 422 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3567  DNA processing protein DprA, putative  50.52 
 
 		 371 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  50 
 
 		 475 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  48.64 
 
 		 422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  49.75 
 
 		 475 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  53.65 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  41.73 
 
 		 377 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  48.29 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  42.78 
 
 		 399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  45.14 
 
 		 364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3125  DNA protecting protein DprA  49.14 
 
 		 425 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  46.6 
 
 		 308 aa  264  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  45.53 
 
 		 358 aa  262  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  46.6 
 
 		 296 aa  262  8.999999999999999e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  40.51 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  39.64 
 
 		 369 aa  253  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  43.73 
 
 		 371 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  42.11 
 
 		 381 aa  253  6e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  42.22 
 
 		 359 aa  252  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  42.11 
 
 		 381 aa  252  7e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  44.68 
 
 		 365 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  44.88 
 
 		 356 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  47.04 
 
 		 311 aa  250  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  43.04 
 
 		 389 aa  249  8e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  43.04 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  43.04 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  43.38 
 
 		 365 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  43.39 
 
 		 366 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  45.1 
 
 		 405 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  44.16 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.79 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  44.33 
 
 		 372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  44.33 
 
 		 366 aa  243  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  49.36 
 
 		 366 aa  243  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  42.81 
 
 		 362 aa  242  7e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  41.41 
 
 		 359 aa  240  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  42.34 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  41.27 
 
 		 377 aa  240  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  43.22 
 
 		 373 aa  239  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  37.24 
 
 		 370 aa  240  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  59.11 
 
 		 362 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  56.47 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  37.67 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  37.04 
 
 		 383 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  56.25 
 
 		 394 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  47.78 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  42.23 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  46.2 
 
 		 365 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  41.15 
 
 		 359 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  36.41 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3788  DNA protecting protein DprA  44.38 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00493314  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  45.91 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  42.72 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  42.02 
 
 		 372 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  41.3 
 
 		 331 aa  229  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  41.77 
 
 		 368 aa  229  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  42.01 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  43.81 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  43.41 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  43.81 
 
 		 374 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>