More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0094 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
320 aa  624  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  63.4 
 
 
307 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  62.58 
 
 
331 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  61.06 
 
 
327 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  61.06 
 
 
327 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  61.49 
 
 
323 aa  357  1e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  61.49 
 
 
323 aa  357  2e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  60.75 
 
 
327 aa  355  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  62.26 
 
 
327 aa  354  9e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  61.56 
 
 
327 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0160  methionyl-tRNA formyltransferase  61.56 
 
 
327 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0129  methionyl-tRNA formyltransferase  61.64 
 
 
328 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  62.58 
 
 
328 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0143  methionyl-tRNA formyltransferase  61.56 
 
 
327 aa  353  3e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2805  methionyl-tRNA formyltransferase  61.56 
 
 
337 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2275  methionyl-tRNA formyltransferase  61.56 
 
 
337 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2353  methionyl-tRNA formyltransferase  61.56 
 
 
337 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  61.25 
 
 
327 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3142  methionyl-tRNA formyltransferase  61.37 
 
 
330 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  61.95 
 
 
327 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  61.64 
 
 
327 aa  349  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2512  methionyl-tRNA formyltransferase  61.37 
 
 
330 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3126  methionyl-tRNA formyltransferase  61.37 
 
 
330 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4415  methionyl-tRNA formyltransferase  63.32 
 
 
328 aa  348  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.628902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3181  methionyl-tRNA formyltransferase  61.64 
 
 
327 aa  348  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  60.95 
 
 
327 aa  348  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  57.47 
 
 
310 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  9.86218e-08 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3877  methionyl-tRNA formyltransferase  57.55 
 
 
323 aa  340  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  58.44 
 
 
344 aa  339  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4690  methionyl-tRNA formyltransferase  61.25 
 
 
329 aa  338  5e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0284  methionyl-tRNA formyltransferase  62.38 
 
 
315 aa  337  1e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0176978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  56.49 
 
 
319 aa  335  8e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  58.99 
 
 
327 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  56.17 
 
 
310 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  6.11556e-15 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0351  methionyl-tRNA formyltransferase  61.2 
 
 
322 aa  334  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  55.16 
 
 
314 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  59.86 
 
 
310 aa  331  9e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  55.19 
 
 
310 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  54.87 
 
 
310 aa  328  6e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  4.39837e-07 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  57.79 
 
 
314 aa  327  1e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0393  methionyl-tRNA formyltransferase  55.48 
 
 
312 aa  324  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.894516  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4638  methionyl-tRNA formyltransferase  57.81 
 
 
357 aa  322  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.857325  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  57.47 
 
 
314 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  55.85 
 
 
311 aa  322  5e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  54.05 
 
 
308 aa  320  1e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  53.87 
 
 
314 aa  318  9e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4081  methionyl-tRNA formyltransferase  54.88 
 
 
330 aa  313  2e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3859  methionyl-tRNA formyltransferase  55.35 
 
 
323 aa  312  4e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5111  methionyl-tRNA formyltransferase  59.62 
 
 
318 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.030161  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  52.44 
 
 
312 aa  308  5e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  57.65 
 
 
325 aa  302  6e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  51.29 
 
 
308 aa  301  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  51.32 
 
 
314 aa  300  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  51.34 
 
 
312 aa  299  5e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  49.36 
 
 
315 aa  298  6e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  50.17 
 
 
321 aa  298  8e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  54.18 
 
 
318 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  52.56 
 
 
310 aa  296  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2078  methionyl-tRNA formyltransferase  51.74 
 
 
332 aa  295  7e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  54.95 
 
 
325 aa  295  8e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  50.83 
 
 
322 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  49.83 
 
 
321 aa  293  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  49.04 
 
 
324 aa  291  8e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0015  methionyl-tRNA formyltransferase  58.71 
 
 
309 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.229268 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  50.17 
 
 
313 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  51.68 
 
 
315 aa  289  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  51.68 
 
 
315 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  51.68 
 
 
315 aa  289  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  51.68 
 
 
315 aa  289  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  51.68 
 
 
315 aa  289  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  51.68 
 
 
315 aa  289  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  51.68 
 
 
315 aa  289  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  50.67 
 
 
315 aa  289  5e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  50.33 
 
 
313 aa  288  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  51.34 
 
 
315 aa  288  6e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  50.5 
 
 
315 aa  287  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  50.5 
 
 
315 aa  287  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  50.5 
 
 
315 aa  287  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  51.68 
 
 
315 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  51.68 
 
 
315 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  51.68 
 
 
315 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  51.68 
 
 
315 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  51.68 
 
 
315 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  51.34 
 
 
315 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1777  methionyl-tRNA formyltransferase  48.62 
 
 
332 aa  286  3e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  54.36 
 
 
297 aa  286  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  50.33 
 
 
315 aa  285  6e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  48.67 
 
 
315 aa  285  6e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  47.99 
 
 
318 aa  285  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  47.19 
 
 
332 aa  285  7e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0415  methionyl-tRNA formyltransferase  46.51 
 
 
311 aa  284  1e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.467918  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  47.65 
 
 
318 aa  285  1e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  47.4 
 
 
348 aa  284  1e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  46.79 
 
 
318 aa  284  1e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  48.17 
 
 
314 aa  284  1e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  51.8 
 
 
310 aa  283  3e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  52.15 
 
 
302 aa  282  4e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  49.5 
 
 
315 aa  283  4e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  48.65 
 
 
312 aa  282  4e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  51.13 
 
 
308 aa  282  5e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  8.00769e-07 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>