240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0089 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1155  radical SAM family protein  56.37 
 
 
658 aa  757  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4370  radical SAM domain-containing protein  75.59 
 
 
634 aa  970  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0070  Radical SAM domain protein  76.8 
 
 
635 aa  986  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4972  radical SAM domain-containing protein  50.39 
 
 
738 aa  679  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991033  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0246  radical SAM domain-containing protein  57.97 
 
 
647 aa  760  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3570  radical SAM domain-containing protein  56.37 
 
 
658 aa  752  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1481  radical SAM family protein  55.62 
 
 
644 aa  744  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.177835  normal  0.151823 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0112  Fe-S oxidoreductase  52.33 
 
 
726 aa  675  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0089  Radical SAM domain protein  100 
 
 
643 aa  1303  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2276  radical SAM domain-containing protein  55.78 
 
 
642 aa  744  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.315011  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1855  radical SAM family protein  76.58 
 
 
638 aa  959  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.357803 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1420  radical SAM domain-containing protein  71.92 
 
 
632 aa  955  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2787  Radical SAM domain protein  53.14 
 
 
732 aa  678  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.231637  normal  0.0637853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3586  Radical SAM domain protein  49.68 
 
 
732 aa  659  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00751133 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3504  radical SAM domain-containing protein  55.94 
 
 
646 aa  746  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0050  radical SAM domain-containing protein  76.49 
 
 
707 aa  983  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0105  radical SAM domain-containing protein  78.01 
 
 
636 aa  988  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1777  Radical SAM domain protein  54.15 
 
 
737 aa  689  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.54513 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0533  radical SAM domain protein  63.7 
 
 
138 aa  176  1e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2450  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 
590 aa  156  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1423  radical SAM/B12 binding domain protein  28.86 
 
 
715 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.623089  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2989  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 
500 aa  106  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0098  radical SAM domain-containing protein  30.89 
 
 
716 aa  105  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3373  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 
503 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0245  radical SAM family protein  27.13 
 
 
502 aa  100  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.62793e-07  hitchhiker  1.42762e-05 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2019  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 
525 aa  99.4  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0788272  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  31.17 
 
 
705 aa  97.8  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0213  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 
429 aa  95.5  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25181  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2521  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 
531 aa  92  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0155875  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 
459 aa  89.4  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2210  radical SAM domain-containing protein  25.31 
 
 
565 aa  89  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6404  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase 66kD subunit  28.02 
 
 
534 aa  85.5  3e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 
494 aa  84  8e-15  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 
494 aa  82.4  2e-14  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  33.54 
 
 
444 aa  81.6  4e-14  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  27.48 
 
 
529 aa  80.5  9e-14  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0879  radical SAM family Fe-S protein  26.01 
 
 
488 aa  79  3e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293304  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.75 
 
 
546 aa  77.4  7e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.908643  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2315  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.02 
 
 
546 aa  74.7  5e-12  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.03087  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0229  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.3 
 
 
547 aa  74.7  5e-12  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2158  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.74 
 
 
546 aa  73.9  8e-12  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1157  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2292  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 
634 aa  73.9  8e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727503  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0316  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.93 
 
 
567 aa  73.2  1e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 
488 aa  73.2  1e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17321e-07 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2209  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.23 
 
 
546 aa  73.2  1e-11  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.561885  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 
487 aa  72.8  2e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2387  cobalamin B12-binding domain protein  23.26 
 
 
545 aa  72.4  2e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  26.48 
 
 
548 aa  70.5  8e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  23.46 
 
 
494 aa  70.5  9e-11  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3233  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 
531 aa  70.1  1e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  23.46 
 
 
494 aa  70.5  1e-10  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1119  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 
525 aa  69.7  1e-10  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0138505  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  23.57 
 
 
723 aa  70.1  1e-10  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1976  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.29 
 
 
546 aa  70.1  1e-10  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175578  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3812  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.9 
 
 
569 aa  69.7  2e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  23.67 
 
 
520 aa  69.7  2e-10  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.97506e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  22.95 
 
 
426 aa  68.9  3e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1584  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.55 
 
 
527 aa  68.6  3e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
1250 aa  68.9  3e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1487  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.47 
 
 
567 aa  68.2  4e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2894  radical SAM family protein  29.23 
 
 
613 aa  68.6  4e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  22.14 
 
 
461 aa  68.2  5e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0512  Radical SAM domain protein  21.37 
 
 
486 aa  67.8  6e-10  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 
521 aa  66.6  1e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1863  radical SAM family protein  25.15 
 
 
486 aa  66.6  1e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300057  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3548  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.85 
 
 
535 aa  66.2  2e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.26 
 
 
476 aa  65.9  2e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  3.8537e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0942  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.15 
 
 
528 aa  64.7  5e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162998  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4778  response regulator receiver protein  23.86 
 
 
675 aa  64.7  5e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0104454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1864  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.23 
 
 
565 aa  64.7  5e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  22.22 
 
 
459 aa  64.3  7e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  26.86 
 
 
484 aa  64.3  7e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 
450 aa  63.9  9e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3863  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.13 
 
 
580 aa  63.9  9e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582854  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2379  Radical SAM domain protein  22.16 
 
 
623 aa  63.5  1e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2281  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  26.97 
 
 
520 aa  63.2  1e-08  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  25 
 
 
473 aa  63.2  2e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  4.24629e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3552  Radical SAM domain protein  24.84 
 
 
488 aa  62.4  3e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 
470 aa  62  3e-08  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1625  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.93 
 
 
558 aa  61.6  4e-08  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 
490 aa  61.6  4e-08  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1590  Radical SAM domain protein  23.98 
 
 
488 aa  61.2  5e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0876  radical SAM family Fe-S protein  27.11 
 
 
461 aa  61.2  5e-08  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  23.8 
 
 
562 aa  61.2  6e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3359  Radical SAM domain protein  24.01 
 
 
539 aa  60.5  9e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1125  Fe-S oxidoreductase  22.49 
 
 
555 aa  60.5  9e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  22.99 
 
 
524 aa  60.1  1e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.72503e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0968  Radical SAM domain protein  21.61 
 
 
630 aa  60.1  1e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 
424 aa  60.1  1e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  23.37 
 
 
472 aa  60.1  1e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4090  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 
462 aa  59.3  2e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2336  radical SAM family Fe-S protein  24.72 
 
 
553 aa  59.3  2e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 
502 aa  59.7  2e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 
471 aa  59.7  2e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  22.62 
 
 
576 aa  58.9  3e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
476 aa  58.5  3e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.93045e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3422  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 
541 aa  58.2  4e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  23.19 
 
 
518 aa  58.5  4e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3401  Radical SAM domain protein  23.43 
 
 
484 aa  58.2  4e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1537  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.53 
 
 
462 aa  58.2  5e-07  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.537529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>